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   TM1040;TM1040
Protein Sequence Comparative Analysis   (PSCA)
 
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TM1040    PDB Fold Similairty





PDB sequences with significant alignments
Sequence information                                           Score	E-value
JCSG997751|pdb|2F8J_A|Histidinol-phosphate aminotransferase       664	0.0
JCSG40823|pdb|1UU1_B|HISTIDINOL-PHOSPHATE AMINOTRANSFERASE        664	0.0
JCSG2873963|pdb|3CQ4_A|Histidinol-phosphate aminotransferase      154	1e-37
JCSG2873964|pdb|3CQ5_A|Histidinol-phosphate aminotransferase      154	1e-37
JCSG2989900|pdb|3HDO_A|Histidinol-phosphate aminotransferase      146	2e-35
JCSG2987309|pdb|3GET_A|Histidinol-phosphate aminotransferase      129	2e-30
JCSG2882224|pdb|3EUC_A|Histidinol-phosphate aminotransferase 2    119	2e-27
JCSG95990|pdb|3FTB_A|Histidinol-phosphate aminotransferase        115	3e-26
JCSG2885394|pdb|3FFH_A|Histidinol-phosphate aminotransferase      115	3e-26
JCSG110117|pdb|1IJI_A|Histidinol Phosphate Aminotransferase       115	5e-26
JCSG3186359|pdb|3P1T_A|Putative histidinol-phosphate aminot...    110	1e-24
JCSG302340|pdb|1O4S_B|Aspartate aminotransferase                  92	6e-19
JCSG144073|pdb|2Z61_A|Probable aspartate aminotransferase 2       84	1e-16
JCSG2915878|pdb|3FKD_A|L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase    78	9e-15
JCSG3299713|pdb|4WBT_B|Probable histidinol-phosphate aminot...    76	4e-14
JCSG228125|pdb|1LKC_A|L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase     64	1e-10
JCSG2880464|pdb|3ELE_A|Amino Transferase                          62	4e-10
JCSG2883486|pdb|3EZS_B|aminotransferase AspB                      62	5e-10
JCSG3164384|pdb|3LY1_D|Putative histidinol-phosphate aminot...    62	7e-10
JCSG3185088|pdb|3P6K_B|Aminotransferase class I and II            60	3e-09
...more
PDB sequence alignments
QUERY       1   MNPLDLIAKRAYPYE---------TEKR--DKTYLALNENPF-PFPEDLVDEVFRRLNSD 48
JCSG997751  13  MNPLDLIAKRAYPYE---------TEKR--DKTYLALNENPF-PFPEDLVDEVFRRLNSD 60
JCSG40823   1   MNPLDLIAKRAYPYE---------TEKR--DKTYLALNENPF-PFPEDLVDEVFRRLNSD 48
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JCSG2989900 31  ----------------------------------LntNENPY-PpspEVVkaILEELGpD 55
JCSG2987309 35  ----------------------------------LAsNENPF-gtPpkaIEcL--RqNAN 57
JCSG2882224 39  --------------------------------------ENPY-rLPpaLrSELaaRLGEv 59
JCSG95990   34  -------------------------------------NiNPL-gIPKSFLNNIdEgIKN- 54
JCSG2885394 35  --------------------------------TkLSsNENPL-gtsKkVA--AIQanSSv 59
JCSG110117  19  ------------PYQ---------SaRRlggNgdVwLNaNeY-PtavEF------QLTQQ 50
JCSG3186359 21  ----------------------------------LAFNENP-----EaVepRVqaaIaAa 41
JCSG302340  42  ------------------------------DvinLTaGEpdF-PtPEpVVEEAvRfLQKg 70
JCSG144073  15  ---MDILAl-AqklE---------SEgK--kviHLeIGEpdF-ntPKpIVDEgIKsLKEg 58
JCSG2915878     ------------------------------------------------------------
JCSG3299713 41  ----------------------------------IGaNESgFgPaPSvLL--AIRQaaGD 64
JCSG228125      ------------------------------------------------------------
JCSG2880464     ------------------------------------------------------------
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JCSG3164384     ------------------------------------------------------------
JCSG3185088     ------------------------------------------------------------

QUERY       49  --ALRI--YYDSPD------EELIEKIL-S-YLD---TD---F---LSKNNVSVGNGADE 87
JCSG997751  61  --ALRI--YYDSPD------EELIEKIL-S-YLD---TD---F---LSKNNVSVGNGADE 99
JCSG40823   49  --ALRI--YYDSPD------EELIEKIL-S-YLD---TD---F---LSKNNVSVGNGADE 87
JCSG2873963 57  --AtELnrYpErda------vELrDELa-A-YIt---kQ---tgvaVTRDNLwAANGSNE 100
JCSG2873964 60  --AtELnrYpErda------vELrDELa-A-YIt---kQ---tgvaVTRDNLwAANGSNE 103
JCSG2989900 56  gaALRI--YpSAsS------QKLrEvag-E-lyg---fD---------pSwIiMANGSDE 93
JCSG2987309 58  --kaHL--Y---PD------DSMIElks-T-laQ---ky---k---VQNENIiIGaGSDQ 93
JCSG2882224 60  --ALNr--YpvpsS------EaLraKLk-E-vMQ---Vp--------AgmEVlLGNGSDE 96
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JCSG144073  59  --ktHy--tdSrgi------lELrEKIs-ElYkDkykAD---I---IpdNiIiTGGSSlg 101
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JCSG228125      ------------------------------------------------------------
JCSG2880464     ------------------------------------------------------------
JCSG2883486 52  ---LNI--YpkSaf------EEsLRaaqrG-FFk---rr---FkieLKENEListlGSrE 93
JCSG3164384     ------------------------------------------------------------
JCSG3185088     ------------------------------------------------------------

QUERY       88  II-Y--VM--MLMF-----D----R---S---VFFP--P--TYSCY--RIFAKAV---GA 118
JCSG997751  100 II-Y--VM--MLMF-----D----R---S---VFFP--P--TYSCY--RIFAKAV---GA 130
JCSG40823   88  II-Y--VM--MLMF-----D----R---S---VFFP--P--TYSCY--RIFAKAV---GA 118
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JCSG2873964 104 IL-q--qL--LqaF-----ggpgrt---A---LgFq--P--SYSmH--pILAKGT---hT 138
JCSG2989900 94  VL-n--nL--IraFaaeg-E----E---i---gYvh--P--SYSyY--gtLAEVq---GA 128
JCSG2987309 94  VI-efaIh--skLn-----S----K---N---AFLq--agvTFAmY--EIYAKqc---GA 128
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JCSG3164384 101 -----------------------------------------TYGdg--EhFAKiA---Gm 114
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QUERY       119 ----K--FLEVP-------L-TK---------D-------L-------R-------I--- 131
JCSG997751  131 ----K--FLEVP-------L-TK---------D-------L-------R-------I--- 143
JCSG40823   119 ----K--FLEVP-------L-TK---------D-------L-------R-------I--- 131
JCSG2873963 136 ----E--FIaVs-------r-ga---------D-------F-------R-------I--- 148
JCSG2873964 139 ----E--FIaVs-------r-ga---------D-------F-------R-------I--- 151
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JCSG2987309 129 ----K--cyKTqs------I-Th---------N-------Ldefk---K-------L--- 146
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JCSG228125      ------------------------------------------------------------
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QUERY       132 P------E------VN---V-----------------GEG----D-------------V- 141
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JCSG40823   132 P------E------VN---V-----------------GEG----D-------------V- 141
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JCSG2873964 152 dmdvaleE------IR---A-----------------kQp----D-------------I- 167
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JCSG3299713 163 ---VYLaNP--DNPmG-----swWpaER----Vvaf-aQa----------L--------- 188
JCSG228125  150 ---LFLcTP--NNPTG-----lLpERpl----L----QaI----------adrck----- 176
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JCSG2883486 158 ---VILnSP--NNPTG-----RTLSlEEliswV----Kla----------L--------- 184
JCSG3164384 145 ---VYLvNP--NNPTG-----tItpaDv----I----Epw----------I--------- 167
JCSG3185088 158 ---IcInNa--NNPTG-----aVMDRty----L----EEL----------V--------- 180

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JCSG997751  177 -K----T----G------A---FVALDEAY----YE---F--------H-GE-----SY- 196
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JCSG3164384 168 -a----Skpa-N------T---MfiVDEAY----aE---F--------v-ND-----pr- 190
JCSG3185088 181 -EiaseV----G------A---YIlsDEVY----rS---F--------s-el-----Dv- 204

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JCSG997751  197 --VD--FL---------KKY-----EN---L------A--------V-IRTFS-----KA 215
JCSG40823   185 --VD--FL---------KKY-----EN---L------A--------V-IRTFS-----KA 203
JCSG2873963 210 --Tt--LL---------EKY-----pTk--L------V--------V-sRTMS-----KA 229
JCSG2873964 213 --Tt--LL---------EKY-----pTk--L------V--------V-sRTMS-----KA 232
JCSG2989900 197 --LE--LV---------RRH-----EN---V------V--------V-tRTLS-----KS 215
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JCSG2915878 178 --IrpadI---------Kgr-----KN---L------V--------M-VySFS-----hA 198
JCSG3299713 210 ppIE--sL---------idk-----pN---V------i--------r-aRTFS-----KA 230
JCSG228125  199 --Ip--aL---------Kdn-----pH---I------w--------V-LRSLT-----Kf 217
JCSG2880464 231 --pf--vt---------KyY-----DN---t------l--------V-cySYS-----KS 249
JCSG2883486 205 --pp--sLleacmlagnEaF-----KN---V------l--------V-IHSLS-----Kr 232
JCSG3164384 191 --fr--sI---------SpmitqgaEN---I------i--------L-LKTFS-----Ki 214
JCSG3185088 205 --pS--II---------EvY-----DK---g------i--------A-VNSLS-----KT 223

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JCSG997751  216 FSLAAQRVGYV----VA---SEKFI---------DA-Y---NRV--R--L-PF-N----V 245
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Note
Homologous search is done using BLAST from NCBI BLAST against database pdbnr with expect (E-value cut-off) at 0.001. The structure of a PDB sequence may be fully or partly solved. The non-redundant database pdbnr consists of unique PDB sequences from the representative PDB chains. Each representative chain has the best structural coverage in the set of the same sequences. You could click a sequence ID to see all of PDB chains associated with the sequence ID plus sequence alignments and structural coverages.



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