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   TM1009;TM1009
Protein Sequence Comparative Analysis   (PSCA)
 
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TM1009    PDB Fold Similairty





PDB sequences with significant alignments
Sequence information                                           Score	E-value
JCSG462243|pdb|1VP5_A|2,5-diketo-D-gluconic acid reductase        580	e-166
JCSG3162132|pdb|4MHB_A|Putative aldo/keto reductase               345	3e-95
JCSG2881438|pdb|3B3D_A|Putative morphine dehydrogenase            259	1e-69
JCSG75945|pdb|3F7J_A|YvgN protein                                 256	2e-68
JCSG2989138|pdb|3D3F_A|YvgN protein                               256	2e-68
JCSG470319|pdb|1VBJ_A|prostaglandin F synthase                    246	2e-65
JCSG311316|pdb|1MZR_A|2,5-diketo-D-gluconate reductase A          233	1e-61
JCSG216490|pdb|1HW6_A|2,5-DIKETO-D-GLUCONIC ACID REDUCTASE        231	5e-61
JCSG210434|pdb|1A80_A|2,5-DIKETO-D-GLUCONIC ACID REDUCTASE A      229	2e-60
JCSG3249406|pdb|4GIE_A|Prostaglandin F synthase                   229	2e-60
JCSG3179935|pdb|3O0K_A|Aldo/keto reductase                        229	2e-60
JCSG3248719|pdb|4G5D_A|Prostaglandin f2-alpha synthase/D-ar...    228	3e-60
JCSG307600|pdb|1M9H_A|2,5-diketo-D-gluconic acid reductase A      225	3e-59
JCSG3296290|pdb|3WBW_A|Putative 2,5-diketo-D-gluconic acid ...    218	4e-57
JCSG3304022|pdb|4Q3M_A|MGS-M4                                     218	4e-57
JCSG3296291|pdb|3WBY_A|Putative 2,5-diketo-D-gluconic acid ...    215	3e-56
JCSG487820|pdb|1ZGD_A|chalcone reductase                          206	1e-53
JCSG3161935|pdb|2WZM_A|ALDO-KETO REDUCTASE                        202	2e-52
JCSG1236|pdb|1QWK_A|aldo-keto reductase family 1 member C1        202	2e-52
JCSG2998508|pdb|3H7R_A|Aldo-keto reductase                        201	5e-52
...more
PDB sequence alignments
QUERY       1   MQVPKVTLNN-G---VEMPILGYGV---F--------Q-----I-------PP-EK---- 28
JCSG462243  13  MQVPKVTLNN-G---VEMPILGYGV---F--------Q-----I-------PP-EK---- 40
JCSG3162132 18  -----VkLNN-G---IaMPLLGFGV---F--------Q-----M-------t---N---- 38
JCSG2881438 42  ----KATLHN-G---VEMPwFGlGV---F--------Q-----V-------eegSE---- 66
JCSG75945   9   -----VkLHN-G---VEMPwFGlGV---F--------K-----V-------engNE---- 32
JCSG2989138 8   -----VkLHN-G---VEMPwFGlGV---F--------K-----V-------engNE---- 31
JCSG470319  14  -------LSN-G---VmMPVLGFGM---W--------K-----L-------qdgNE---- 35
JCSG311316  28  -----IkLQD-G---nvMPqLGlGV---W--------Q-----a-------sn-EE---- 50
JCSG216490  1   MtVPSIVLND-G---nSIPqLGYGV---F--------K-----V-------PP-ad---- 28
JCSG210434  2   --VPSIVLND-G---nSIPqLGYGV---F--------K-----V-------PP-ad---- 27
JCSG3249406 16  -----VTLHN-S---VRMPqLGlGV---W--------R-----a-------qdgaE---- 39
JCSG3179935 24  MtVPtVkLND-G---nHIPqLGYGV---W--------Q-----I-------sn-DE---- 51
JCSG3248719 13  -----VTLSN-G---VKMPqFGlGV---W--------Q-----s-------PagEv---- 36
JCSG307600  1   MtVPSIVLND-G---nSIPqLGYGV---Y--------K-----V-------PP-ad---- 28
JCSG3296290 17  -----ISFHD-G---htMPqIGlGV---W--------E-----t-------PP-DE---- 39
JCSG3304022 4   -----VkLNN-N---yEMPIIGlGT---F--------R-----s-------kk-Nd---- 26
JCSG3296291 17  -----ISFHD-G---htMPqIGlGV---W--------E-----t-------PP-DE---- 39
JCSG487820  4   VEIPtkVLTN-tssqLKMPVVGmGs---a--------pdf---t-------ck-Kd---- 36
JCSG3161935 11  --IPtVTLND-d---ntLPVVGiGV---g--------E-----L-------sd-SE---- 36
JCSG1236    8   -----IkLSN-G---VEMPVIGlGT---W--------Q-----s-------sP-aE---- 30
JCSG2998508 30  -------LNT-G---AKLPcVGlGT---Y--------a-----M-------va-ta---- 50

QUERY       29  ---------TE------E-----C-----VYE----AIKV----GYRLIDTA---ASY-- 50
JCSG462243  41  ---------TE------E-----C-----VYE----AIKV----GYRLIDTA---ASY-- 62
JCSG3162132 39  ---------Ta------E-----Cera--ViD----AIET----GYRLIDTA---ASY-- 63
JCSG2881438 67  ---------lv------N-----A-----Vkt----AIvh----GYRsIDTA---AiY-- 88
JCSG75945   33  ---------At------E-----s-----Vka----AIKn----GYRsIDTA---AiY-- 54
JCSG2989138 32  ---------At------E-----s-----Vka----AIKn----GYRsIDTA---AiY-- 53
JCSG470319  36  ---------AE------t-----A-----Tmw----AIKs----GYRhIDTA---AiY-- 57
JCSG311316  51  ---------Vi------t-----A-----IqK----ALEV----GYRsIDTA---AAY-- 72
JCSG216490  29  ---------TQ------R-----A-----VeE----ALEV----GYRhIDTA---AiY-- 50
JCSG210434  28  ---------TQ------R-----A-----VeE----ALEV----GYRhIDTA---AiY-- 49
JCSG3249406 40  ---------Ta------N-----A-----Vrw----AIEA----GYRhIDTA---yiY-- 61
JCSG3179935 52  ---------Av------S-----A-----VsE----ALKA----GYRhIDTA---TiY-- 73
JCSG3248719 37  ---------TE------N-----A-----Vkw----ALcA----GYRhIDTA---AiY-- 58
JCSG307600  29  ---------TQ------R-----A-----VeE----ALEV----GYRhIDTA---AiY-- 50
JCSG3296290 40  ---------Ta------E-----v-----VkE----AVKL----GYRsVDTA---rlY-- 61
JCSG3304022 27  ---------Ay------N-----A-----Vka----ALEg----GYRhIDTA---miY-- 48
JCSG3296291 40  ---------Ta------E-----v-----VkE----AVKL----GYRsVaTA---rlY-- 61
JCSG487820  37  ---------TK------D-----A-----IiE----AIKq----GYRhFDTA---AAY-- 58
JCSG3161935 37  ---------AE------R-----s-----Vsa----ALEA----GYRLIDTA---AAY-- 58
JCSG1236    31  ---------Vi------t-----A-----Vkt----AVKA----GYRLIDTA---SvY-- 52
JCSG2998508 51  ---------iE------Q------------------AIKI----GYRhIDcA---SiY-- 68

QUERY       51  --------MN---EEGVGRA-IKRAIDEG-I--VR-RE--ELFVTTK----L-------- 80
JCSG462243  63  --------MN---EEGVGRA-IKRAIDEG-I--VR-RE--ELFVTTK----L-------- 92
JCSG3162132 64  --------QN---EtqVGNA-LKlS---G-I--AR--D--ELFITTK----L-------- 89
JCSG2881438 89  --------gN---EaGVGEG-IREGIEEA-g--Is-RE--DLFITSK----V-------- 118
JCSG75945   55  --------kN---EEGVGiG-IK----ES-g--Va-RE--ELFITSK----V-------- 80
JCSG2989138 54  --------kN---EEGVGiG-IK----ES-g--Va-RE--ELFITSK----V-------- 79
JCSG470319  58  --------kN---EESAGRA-IasCg-------Vp-RE--ELFVTTK----L-------- 83
JCSG311316  73  --------kN---EEGVGKA-LKNAs-------VN-RE--ELFITTK----L-------- 98
JCSG216490  51  --------gN---EEGVGaA-IaaS---G-I--AR--D--DLFITTK----L-------- 76
JCSG210434  50  --------gN---EEGVGaA-IaaS---G-I--AR--D--DLFITTK----L-------- 75
JCSG3249406 62  --------sN---ERGVGQG-IR----ES-g--Vp-RE--EVWVTTK----V-------- 87
JCSG3179935 74  --------gN---EEGVGKA-INgS---G-I--AR-aD---IFLTTK----L-------- 99
JCSG3248719 59  --------kN---EESVGaG-LRaSg-------Vp-RE--DVFITTK----L-------- 84
JCSG307600  51  --------gN---EEGVGaA-IaaS---G-I--AR--D--DLFITTK----L-------- 76
JCSG3296290 62  --------kN---EEGVGK---------G-L--ed-Hp--EIFLTTK----L-------- 83
JCSG3304022 49  --------gN---EEeVGRA-IK----DS-n--Ip-RE--EIFVTTK----L-------- 74
JCSG3296291 62  --------kN---EEGVGK---------G-L--ed-Hp--EIFLTTK----L-------- 83
JCSG487820  59  --------gS---EQALGEA-LKEAIElG-L--Vt-RD--DLFVTSK----L-------- 88
JCSG3161935 59  --------gN---EaAVGRA-IaaSg-------Ip-RD--EIYVTTK----L-------- 84
JCSG1236    53  --------QN---EEAIGtA-IKElLEEG-V--VK-RE--ELFITTK----a-------- 82
JCSG2998508 69  --------gN---EKeIGgV-LKKlIgDG-F--VK-RE--ELFITSK----L-------- 98

QUERY       81  --WV------SDVGY--------EST-------------K------------K------- 92
JCSG462243  93  --WV------SDVGY--------EST-------------K------------K------- 104
JCSG3162132 90  --WL------QDTyY--------EGA-------------K------------a------- 101
JCSG2881438 119 --Wn------ADLGY--------EET-------------l------------a------- 130
JCSG75945   81  --Wn------EDqGY--------ETT-------------l------------a------- 92
JCSG2989138 80  --Wn------EDqGY--------ETT-------------l------------a------- 91
JCSG470319  84  --Wn------SDqGY--------EST-------------l------------S------- 95
JCSG311316  99  --Wn------DD--H--------Krp-------------R------------E------- 108
JCSG216490  77  --Wn------Drhdg--------DEp-------------a------------a------- 88
JCSG210434  76  --Wn------Drhdg--------DEp-------------a------------a------- 87
JCSG3249406 88  --Wn------SDqGY--------EKT-------------l------------a------- 99
JCSG3179935 100 --Wn------SDqGY--------EST-------------l------------K------- 111
JCSG3248719 85  --Wn------TEqGY--------EST-------------l------------a------- 96
JCSG307600  77  --Wn------Drhdg--------DEp-------------a------------a------- 88
JCSG3296290 84  --Wn------DEqGY--------DST-------------l------------R------- 95
JCSG3304022 75  --Wn------TDqGY--------EKT-------------l------------E------- 86
JCSG3296291 84  --Wn------DEqGY--------DST-------------l------------R------- 95
JCSG487820  89  --WV------TEnhp--------HlV-------------i------------p------- 100
JCSG3161935 85  --aT------pDqGF--------tSS-------------Q------------a------- 96
JCSG1236    83  --WT------hELAp--------gKl-------------E------------g------- 94
JCSG2998508 99  --Ws------NDhlp--------EDV-------------p------------K------- 110

QUERY       93  A-----F------------EK---------SLKKLQLEYIDLYLIH---Q--P------F 115
JCSG462243  105 A-----F------------EK---------SLKKLQLEYIDLYLIH---Q--P------F 127
JCSG3162132 102 q-----F------------ER---------SLNRLQLDYVDLYLIH---Q--P------Y 124
JCSG2881438 131 A-----F------------Et---------SLSKLgLDYLDLYLIH---w--P------v 153
JCSG75945   93  A-----F------------EK---------SLERLQLDYLDLYLIH---w--P------g 115
JCSG2989138 92  A-----F------------EK---------SLERLQLDYLDLYLIH---w--P------g 114
JCSG470319  96  A-----F------------EK---------SIKKLgLEYVDLYLIH---w--P------g 118
JCSG311316  109 A-----L------------ld---------SLKKLQLDYIDLYLMH---w--P------v 131
JCSG216490  89  A-----I------------aE---------SLaKLaLDqVDLYLVH---w--P------t 111
JCSG210434  88  A-----I------------aE---------SLaKLaLDqVDLYLVH---w--P------t 110
JCSG3249406 100 A-----F------------ER---------SrElLgLEYIDLYLIH---w--Pgkkk--F 126
JCSG3179935 112 A-----F------------Dt---------SLKKLgtDYVDLYLIH---w--P------M 134
JCSG3248719 97  A-----F------------EE---------SrQKLgVDYIDLYLIH---w--P------r 119
JCSG307600  89  A-----I------------aE---------SLaKLaLDqVDLYLVH---w--P------t 111
JCSG3296290 96  A-----Y------------EE---------SaRlLRrpvLDLYLIH---w--P------M 118
JCSG3304022 87  A-----F------------Nt---------SLKNLgLDYIDLYLIHwf-K--g------Y 111
JCSG3296291 96  A-----Y------------EE---------SaRlLRrpvLDLYLIH---w--P------M 118
JCSG487820  101 A-----L------------QK---------SLKtLQLDYLDLYLIH---w--P------L 123
JCSG3161935 97  A-----a------------Ra---------SLERLgLDYVDLYLIH---w--P------g 119
JCSG1236    95  G-----L------------RE---------SLKKLQLEYVDLYLaH---M--Paa----F 119
JCSG2998508 111 A-----L------------EK---------TLQdLQIDYVDLYLIH---w--P------a 133

QUERY       116 ------------------------------G---------------------D------- 117
JCSG462243  128 ------------------------------G---------------------D------- 129
JCSG3162132 125 ------------------------------G---------------------D------- 126
JCSG2881438 154 e-----------------------------G---------------------k------- 156
JCSG75945   116 ------------------------------k---------------------D------- 117
JCSG2989138 115 ------------------------------k---------------------D------- 116
JCSG470319  119 ------------------------------k---------------------D------- 120
JCSG311316  132 ------------------------------p---------------------a------- 133
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JCSG210434  111 paad--------------------------N---------------------y------- 116
JCSG3249406 127 ------------------------------v---------------------D------- 128
JCSG3179935 135 ------------------------------p---------------------S------- 136
JCSG3248719 120 ------------------------------Gk--------------------D------- 122
JCSG307600  112 paad--------------------------N---------------------y------- 117
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JCSG3304022 112 ------------------------------d---------------------N------- 113
JCSG3296291 119 paq---------------------------G---------------------Q------- 123
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JCSG3161935 120 ------------------------------G---------------------D------- 121
JCSG1236    120 ------------------------------N---------------------Ddmsehia 128
JCSG2998508 134 ------------------------------Slkkeslmptpemltkp-----D------- 151

QUERY       118 ----------V----------------HC-----------------------A------- 121
JCSG462243  130 ----------V----------------HC-----------------------A------- 133
JCSG3162132 127 ----------V----------------Hg-----------------------A------- 130
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JCSG75945   118 ----------k----------------Ykd----------------------T------- 122
JCSG2989138 117 ----------k----------------Ykd----------------------T------- 121
JCSG470319  121 ----------k----------------fid----------------------T------- 125
JCSG311316  134 ----------I----------------dhyve--------------------A------- 140
JCSG216490  118 ----------V----------------H------------------------A------- 120
JCSG210434  117 ----------V----------------H------------------------A------- 119
JCSG3249406 129 ----------T------------------------------------------------- 129
JCSG3179935 137 ----------k----------------dlfme--------------------T------- 143
JCSG3248719 123 ----------I----------------lskegkkyld---------------S------- 134
JCSG307600  118 ----------V----------------H------------------------A------- 120
JCSG3296290 124 ----------y----------------ve-----------------------T------- 127
JCSG3304022 114 ----------A----------------ls-----------------------T------- 117
JCSG3296291 124 ----------y----------------ve-----------------------T------- 127
JCSG487820  144 ----------V----------------kg-----------------------V------- 147
JCSG3161935 122 ----------T----------------skyvd--------------------S------- 128
JCSG1236    129 sp--------V----------------Ed-----------------------V------- 134
JCSG2998508 152 ----------I----------------ts-----------------------T------- 155

QUERY       122 --------W-------------K--AMEEMY---KDGLVRAIGVSN---F---YPDR--- 146
JCSG462243  134 --------W-------------K--AMEEMY---KDGLVRAIGVSN---F---YPDR--- 158
JCSG3162132 131 --------W-------------R--AMEELH---QaGkIRAIGVSN---F---HPDR--- 155
JCSG2881438 161 --------W-------------R--ALEtLY---KEGrIKAIGVSN---F---qihH--- 185
JCSG75945   123 --------W-------------R--ALEKLY---KDGkIRAIGVSN---F---qvhH--- 147
JCSG2989138 122 --------W-------------R--ALEKLY---KDGkIRAIGVSN---F---qvhH--- 146
JCSG470319  126 --------W-------------K--AFEKLY---aDkkVRAIGVSN---F---HehH--- 150
JCSG311316  141 --------W-------------K--GMiELq---KEGLIKSIGVcN---F---qihH--- 165
JCSG216490  121 --------W-------------E--kMiELr---aaGLTRSIGVSN---h---lvpH--- 145
JCSG210434  120 --------W-------------E--kMiELr---aaGLTRSIGVSN---h---lvpH--- 144
JCSG3249406 130 --------W-------------K--ALEKLY---EEkkVRAIGVSN---F---ePhH--- 154
JCSG3179935 144 --------W-------------R--AFiKLk---EEGrVKSIGVSN---F---rtad--- 168
JCSG3248719 135 --------W-------------R--AFEQLY---KEkkVRAIGVSN---F---HihH--- 159
JCSG307600  121 --------W-------------E--kMiELr---aaGLTRSIGVSN---h---lvpH--- 145
JCSG3296290 128 --------W-------------K--ALvELk---KSGrVKSIGVSN---F---esEH--- 152
JCSG3304022 118 --------Y-------------R--AFEtLY---EEGkVKAIGVSN---F---nvhH--- 142
JCSG3296291 128 --------W-------------K--ALvELk---KSGrVKSIGVSN---F---esEH--- 152
JCSG487820  148 --------W-------------E--SMEEsl---KlGLTKAIGVSN---F---svkK--- 172
JCSG3161935 129 --------W-------------g--GLmKVk---EDGIARSIGVcN---F---gaEd--- 153
JCSG1236    135 --------W-------------R--qFDaVY---KaGLAKAVGVSN---W---nnDQ--- 159
JCSG2998508 156 --------W-------------K--AMEaLY---dSGkARAIGVSN---F---sskK--- 180

QUERY       147 LMD----LM----VHH----EIV-------P-----AVNQIE---IHPFYQ---RQEE-- 174
JCSG462243  159 LMD----LM----VHH----EIV-------P-----AVNQIE---IHPFYQ---RQEE-- 186
JCSG3162132 156 LaD----LM----AfN----KII-------P-----AVNQIE---VNPFnQ---QlHa-- 183
JCSG2881438 186 LeD----LM----Taa----EIk-------P-----mINQVE---FHPrlt---QKEl-- 213
JCSG75945   148 LeE----LL----kda----EIk-------P-----mVNQVE---FHPrlt---QKEl-- 175
JCSG2989138 147 LeE----LL----kda----EIk-------P-----mVNQVE---FHPrlt---QKEl-- 174
JCSG470319  151 IeE----LL----kHc----KVA-------P-----mVNQIE---LHPLlN---QKal-- 178
JCSG311316  166 LQr----LI----dEt----gVT-------P-----VINQIE---LHPLmQ---QRQl-- 193
JCSG216490  146 Ler----IV----Aat----gVV-------P-----AVNQIE---LHPaYQ---QREi-- 173
JCSG210434  145 Ler----IV----Aat----gVV-------P-----AVNQIE---LHPaYQ---QREi-- 172
JCSG3249406 155 LtE----LF----ksc----KIr-------P-----mVNQVE---LHPLFQ---QRtl-- 182
JCSG3179935 169 Ler----LI----kEs----gVT-------P-----VLNQIE---LHPqFQ---QDEl-- 196
JCSG3248719 160 LeD----VL----Amc----tVT-------P-----mVNQVE---LHPLnN---QaDl-- 187
JCSG307600  146 Ler----IV----Aat----gVV-------P-----AVNQIE---LHPaYQ---QREi-- 173
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JCSG3296291 153 Ler----IM----dat----gVV-------P-----VVNQIE---LHPdFQ---QRal-- 180
JCSG487820  173 LeN----LL----sva----tVL-------P-----AVNQVE---MNlaWQ---QKKl-- 200
JCSG3161935 154 Let----IV----slt----yFT-------P-----AVNQIE---LHPLlN---Qaal-- 181
JCSG1236    160 Isr----aL----Alg----ltp-------v-----hnSQVE---LHlYFp---QHDH-- 187
JCSG2998508 181 LtD----LL----nva----RVT-------P-----AVNQVE---cHPvWQ---QQgl-- 208

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JCSG462243  187 I---EFM---R---NYNIQPEAW---------GP----F-----A--------------- 204
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JCSG2881438 214 I---RYc---Q---NqGIQmEAW---------SP----L-----m--------------- 231
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JCSG307600  199 --------g--a---------ep---VtA-----------------------aAaaH--- 210
JCSG3296290 204 --------S--D---------er---IgK-----------------------IAEKH--- 215
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JCSG487820  230 --------E--N---------dM---LKE-----------------------IADaH--- 241
JCSG3161935 205 --------D--H---------pA---VtA-----------------------IAEaH--- 216
JCSG1236    230 --------Q--D---------qn---VlA-----------------------LAEKt--- 241
JCSG2998508 239 --------Q--N---------pI---VtE-----------------------VAEKl--- 250

QUERY       212 -----GK-TVAQVILRW-L-T-QKG--I-V--A----I-P--KTVRR--ERMKENI-S-I 246
JCSG462243  224 -----GK-TVAQVILRW-L-T-QKG--I-V--A----I-P--KTVRR--ERMKENI-S-I 258
JCSG3162132 221 -----GK-SVGQVVLRW-I-f-QRG--I-V--S----L-a--KSVRK--gRMEENI-N-I 255
JCSG2881438 249 -----NK-SVAQIILRW-d-l-QhG--I-I--T----I-P--KSTKE--HRIKENa-S-V 283
JCSG75945   211 -----NK-SVAQVILRW-d-l-QhG--V-V--T----I-P--KSIKE--HRIiENa-D-I 245
JCSG2989138 210 -----NK-SVAQVILRW-d-l-QhG--V-V--T----I-P--KSIKE--HRIiENa-D-I 244
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JCSG311316  231 -----GK-TpAQIVIRW-h-l-DSG--L-V--V----I-P--KSVtp--SRIaENF-D-V 265
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JCSG3249406 221 -----NK-SpAQVVIRW-d-i-QhG--I-V--T----I-P--KSTNK--gRIQENF-N-V 255
JCSG3179935 232 -----AK-SVAQIILRW-h-i-EtG--n-I--V----I-P--KSItp--aRIKENF-D-I 266
JCSG3248719 223 -----NK-TAAQVILRW-n-i-QKN--L-I--T----I-P--KSVHR--ERIEENa-D-I 257
JCSG307600  211 -----GK-TpAQAVLRW-h-l-QKG--F-V--V----F-P--gSVRR--EHLEENL-D-V 245
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JCSG487820  242 -----GK-SVAQIsLRW-L-y-EQG--V-T--f----V-P--KSydK--ERMNQNL-r-I 276
JCSG3161935 217 -----GR-TAAQVLLRW-s-i-QlG--n-V--V----I-s--RSANp--ERIaSNL-D-V 251
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JCSG2998508 251 -----GK-TTAQVaLRW-g-l-QtG--h-s--V----L-P--KSssg--aRLKENL-D-V 285

QUERY       247 FDFELTQEDMEKIATLDEGQ--SAFFSHR---DPEVVKWICSLKR 286
JCSG462243  259 FDFELTQEDMEKIATLDEGQ--SAFFSHR---DPEVVKWICSLKR 298
JCSG3162132 256 LDFELSaEDMlQIAALDtAt--SAFFSHR---DPaMVEWLtGrK- 294
JCSG2881438 284 FDFELTQDDMNRIdALNE--------------------------- 301
JCSG75945   246 FDFELSQEDMDKIdALNKdE------------------------- 265
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JCSG216490  246 FDFDLTDtEIaaIdAMDpGD--GS--------------------- 267
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JCSG3248719 258 FDFELgaEDVmSIdALN---------------------------- 274
JCSG307600  246 FDFDLTDtEIaaIdAMDpGD--GS--------------------- 267
JCSG3296290 251 FgFvLdaDDMQaIeqMDRkD--GrMgA-----DPNTAKF------ 282
JCSG3304022 244 FDFtLdEEDMKSIrSVNtGK--KiF-------------------- 266
JCSG3296291 251 FgFvLdaDDMQaIeqMDRkD--GrMgA-----DPNTAKF------ 282
JCSG487820  277 FDWSLTKEDhEKIAqIkQNR------------------------- 296
JCSG3161935 252 FgFELTaDEMEtLngLDDG-------------------------- 270
JCSG1236    277 FDFSLTEEDIaKLeeskNSQ--rlF-------------------- 299
JCSG2998508 286 FDWSIpEDlFtKFSNIpQ--------------------------- 303

Note
Homologous search is done using BLAST from NCBI BLAST against database pdbnr with expect (E-value cut-off) at 0.001. The structure of a PDB sequence may be fully or partly solved. The non-redundant database pdbnr consists of unique PDB sequences from the representative PDB chains. Each representative chain has the best structural coverage in the set of the same sequences. You could click a sequence ID to see all of PDB chains associated with the sequence ID plus sequence alignments and structural coverages.



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