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   TM0312;TM0312
Protein Sequence Comparative Analysis   (PSCA)
 
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TM0312    PDB Fold Similairty





PDB sequences with significant alignments
Sequence information                                           Score	E-value
JCSG485271|pdb|1ZH8_A|Oxidoreductase                              642	0.0
JCSG3209137|pdb|3RC1_A|Sugar 3-ketoreductase                      97	1e-20
JCSG3209138|pdb|3RC7_A|Sugar 3-ketoreductase                      96	3e-20
JCSG3209140|pdb|3RCB_A|Sugar 3-ketoreductase                      96	3e-20
JCSG3209139|pdb|3RC9_A|Sugar 3-ketoreductase                      95	6e-20
JCSG3256161|pdb|4HAD_A|Probable oxidoreductase protein            91	1e-18
JCSG3254759|pdb|4GQA_C|NAD binding Oxidoreductase                 79	3e-15
JCSG2772641|pdb|4KOA_A|1,5-anhydro-D-fructose reductase           78	7e-15
JCSG2865669|pdb|3DB2_A|putative NADPH-dependent oxidoreductase    77	1e-14
JCSG1489517|pdb|2GLX_A|1,5-anhydro-D-fructose reductase           77	2e-14
JCSG3192933|pdb|3Q2K_A|oxidoreductase                             77	2e-14
JCSG3229914|pdb|3V5N_A|Oxidoreductase                             75	6e-14
JCSG2391714|pdb|3EZY_A|Dehydrogenase                              73	3e-13
JCSG2877059|pdb|3E82_D|Putative oxidoreductase                    73	3e-13
JCSG221477|pdb|1H6A_A|PRECURSOR FORM OF GLUCOSE-FRUCTOSE O...     72	4e-13
JCSG217883|pdb|1OFG_A|GLUCOSE-FRUCTOSE OXIDOREDUCTASE             72	4e-13
JCSG470085|pdb|1RYD_A|glucose-fructose oxidoreductase             72	4e-13
JCSG214674|pdb|1EVJ_A|GLUCOSE-FRUCTOSE OXIDOREDUCTASE             71	1e-12
JCSG2393794|pdb|3E18_A|oxidoreductase                             71	1e-12
JCSG3251741|pdb|4FB5_A|Probable oxidoreductase protein            59	3e-09
...more
PDB sequence alignments
QUERY       1   MKPLRKIRLGIVGCG-IA---A--R--E---------LH--LPALK---N---------L 29
JCSG485271  14  -KPLRKIRLGIVGCG-IA---A--R--E---------LH--LPALK---N---------L 41
JCSG3209137 28  ------IRVGVIGCA-di---A--w--R---------ra--LPALE-------------a 49
JCSG3209138 28  ------IRVGVIGCA-di---A--w--R---------ra--LPALE-------------a 49
JCSG3209140 28  ------IRVGVIGCA-di---A--w--R---------ra--LPALE-------------a 49
JCSG3209139 28  ------IRVGVIGCA-di---A--w--R---------ra--LPALE-------------a 49
JCSG3256161 24  ------LRFGIIStA-ki---G--R--D---------nv--VPAIQ---D---------a 46
JCSG3254759 26  -----RLNIGLIGsG-Fm---G--Q--ahadayrraaMf--yPdLp---K---------r 58
JCSG2772641 2   ------IRwGLIGAS-ti---A--R--E---------wv--IgAIR---a---------a 24
JCSG2865669 6   --------VGVAAiG-LG---r--w--a---------yv--Maday---T---------k 26
JCSG1489517 2   -------RwGLIGAS-ti---A--R--E---------wv--IgAIR---a---------t 23
JCSG3192933 29  ----RKIRFGLVGCG-ri---S--K--N----------H--IgAIa---Q---------h 52
JCSG3229914 36  ----KRIRLGMVGgG-sG---Afig--a---------VH--riAaR---l---------d 62
JCSG2391714 3   ------LRIGVIGlG-ri---G--t------------IH--aenLK---m---------I 24
JCSG2877059 8   ------INIALIGyG-FV---G--K--t---------FH--aPlIR---S---------V 30
JCSG221477  82  ----RRFgyAIVGlG-ky---A--l--N---------qi--LPGFa---G---------c 106
JCSG217883  30  ----RRFgyAIVGlG-ky---A--l--N---------qi--LPGFa---G---------c 54
JCSG470085  36  ----RRFgyAIVGlG-ky---A--l--N---------qi--LPGFa---G---------c 60
JCSG214674  1   ----RRFgyAIVGlG-ky---A--l--N---------qi--LPGFa---G---------c 25
JCSG2393794 3   ---LKKyQLvIVGyG--G---m--g--S---------yH--V-TLa---S---------a 26
JCSG3251741 23  MKPLg---IGLIGtG-ym---G--Kcha---------La--wnAVK---TvfgdverprL 59

QUERY       30  SHLFEITAVTSRT--RSHAEE-F---AKMVG-NPA---V---F--DSY-EEL------LE 67
JCSG485271  42  SHLFEITAVTSRT--RSHAEE-F---AKxVG-NPA---V---F--DSY-EEL------LE 79
JCSG3209137 50  EpLtEVTAIASRr--wDRAKR-F---TErfG-Gep---V------EGY-paL------LE 86
JCSG3209138 50  EpLtEVTAIASRr--wDRAKR-F---TErfG-Gep---V------EGY-paL------LE 86
JCSG3209140 50  EpLtEVTAIASRr--wDRAKR-F---TErfG-Gep---V------EGY-paL------LE 86
JCSG3209139 50  EpLtEVTAIASRr--wDRAKR-F---TErfG-Gep---V------EGY-paL------LE 86
JCSG3256161 47  ENcv-VTAIASRd--lTRARE-M---AdrfS-vPh---A---F--gSY-EEM------La 83
JCSG3254759 59  pHLY---ALADQd--QAmAER-h---AakLG-aek---A---Y--gDW-REL------VN 93
JCSG2772641 25  Gg--EVVSVmSsS--aERGEa-Y---AaenG-iak---A---v--tSv-DDL------Vg 60
JCSG2865669 27  SEkLKLVTcySRT--EDkrEK-F---GKry--NcA---g---d--aTm-EaL------La 63
JCSG1489517 24  Gg--EVVSMmStS--aERGaa-Y---AtenG-igk---s---v--tSv-EEL------Vg 59
JCSG3192933 53  GdraELVeIcD-T--NpEAlQ-a---AEaAt-Gar---p---F--SSl-SDM------La 89
JCSG3229914 63  DHyelVAGAlSsT--pEkAEa-s---GReLGlDPSr--V---Y--SDF-KEMaireakLK 108
JCSG2391714 25  DdaI-LyAISDvr--EDRlRE-M---kEkLG-vek---A---Y--kDp-HEL------IE 61
JCSG2877059 31  pgL-NLAfVASRd--E---EK-v---kRdLp-DvT---V---I--aSp-Eaa------VQ 64
JCSG221477  107 QHs-RIeALVSgN--aEkAKi-v---AaeyGvDPr---kiydY--SNF-DKI------aK 147
JCSG217883  55  QHs-RIeALVSgN--aEkAKi-v---AaeyGvDPr---kiydY--SNF-DKI------aK 95
JCSG470085  61  QHs-RIeALVSgN--aEkAKi-v---AaeyGvDPr---kiydY--SNF-DKI------aK 101
JCSG214674  26  QHs-RIeALVDgN--aEkAKi-v---AaeyGvDPr---kiydY--SNF-DKI------aK 66
JCSG2393794 27  AdnLEVhGVfDil--aEkrEa-a---AQk---Glk---I---Y--ESY-EaV------La 62
JCSG3251741 60  vHLaEaNAglAEA--RAgefg-F---eKaTA-D--------------W-RaL------Ia 91

QUERY       68  SG-L-VDAVDLTLPV----ELNLPFIEKALRKG--VHVICEKPISTDVETGKKVVE-LS- 117
JCSG485271  80  SG-L-VDAVDLTLPV----ELNLPFIEKALRKG--VHVICEKPISTDVETGKKVVE-LS- 129
JCSG3209137 87  rd-d-VDAVyVpLPA----vLHaeWIDRALRaG--kHVLAEKPLTTDrpqAERLfa-VA- 136
JCSG3209138 87  rd-d-VDAVyVpLPA----vLHaeWIDRALRaG--kHVLAEKPLTTDrpqAERLfa-VA- 136
JCSG3209140 87  rd-d-VDAVyVpLPA----vLHaeWIDRALRaG--kHVLAEEPLTTDrpqAERLfa-VA- 136
JCSG3209139 87  rd-d-VDAVyVpLPA----vLHaeWIDRALRaG--kHVLAEaPLTTDrpqAERLfa-VA- 136
JCSG3256161 84  Sd-V-IDAVyIpLPT----SqHIeWsiKAadaG--kHVVCEKPLAlkAgdidaVIa-ar- 133
JCSG3254759 94  Dp-q-VDVVDITsPn----HLHytMamaAIaaG--kHVyCEKPLAVNeQqAQEMAQ-aA- 143
JCSG2772641 61  Dp-d-VDAVyISttn----ELHhgqalaAIRaG--kHVLCEKPLAmNLNdGcEMVl-kA- 110
JCSG2865669 64  re-d-VEmViITVPn----DkHaevIEQCaRSG--kHIyvEKPISVSLDhAQRIdQ-Vi- 113
JCSG1489517 60  Dp-d-VDAVyVSttn----ELHreqtlaAIRaG--kHVLCEKPLAmtLEdAREMVv-aA- 109
JCSG3192933 90  QG-n-ADALvLAtPs----gLHpwqaiEVaQaG--rHVVsEKPMATrwEdGKRMVK-ac- 139
JCSG3229914 109 NG---IEAVaIVtPn----HVHyaaaKEfLKRG--IHVICDKPLTStLadAKKLkK-aA- 157
JCSG2391714 62  Dp-n-VDAVlVcssT----NtHseLViaCaKak--kHVFCEKPLSlNLadvdRMIE-eT- 111
JCSG2877059 65  hp-d-VDlVvIAsPn----atHaPLaRlALNaG--kHVVvDKPFTlDMQeARELIa-LA- 114
JCSG221477  148 Dp-k-IDAVyIiLPn----SLHaeFaiRAFKaG--kHVMCEKPMATSVadcQRMID-aA- 197
JCSG217883  96  Dp-k-IDAVyIiLPn----SLHaeFaiRAFKaG--kHVMCEKPMATSVadcQRMID-aA- 145
JCSG470085  102 Dp-k-IDAVyIiLPn----SLHaeFaiRAFKaG--kHVMCEKPMATSVadcQRMID-aA- 151
JCSG214674  67  Dp-k-IDAVyIiLPn----SLHaeFaiRAFKaG--kHVMCEKPMATSVadcQRMID-aA- 116
JCSG2393794 63  De-k-VDAVlIAtPn----DsHkeLaiSALEaG--kHVVCEKPVTmtsEdllaIMD-VA- 112
JCSG3251741 92  Dp-e-VDVVSVTtPn----QFHaeMaiaALEaG--kHVwCEKPMApayadAERMLa-tA- 141

QUERY       118 EK-S-EK---TVYIAENF--R--HVPAFWK-AKE-LVESGAIG-----D-PV-FMNW--- 156
JCSG485271  130 EK-S-EK---TVYIAENF--R--HVPAFWK-AKE-LVESGAIG-----D-PV-FxNW--- 168
JCSG3209137 137 R----ER---gLlLmENF--mflHhPqhrQ-VaD-MLDEGVIG-----E-ir-sFaa--- 175
JCSG3209138 137 R----ER---gLlLmENF--mflHhPqhrQ-VaD-MLDEGVIG-----E-ir-sFaa--- 175
JCSG3209140 137 R----ER---gLlLmENF--mflHhPqhrQ-VaD-MLDEGVIG-----E-ir-sFaa--- 175
JCSG3209139 137 R----ER---gLlLmENF--mflHhPqhrQ-VaD-MLDEGVIG-----E-ir-sFaa--- 175
JCSG3256161 134 DR-N-Kv---VVteAymI--t--YsPVWqK-VRS-LIDEGAIG-----S-lr-hVQg--- 172
JCSG3254759 144 RR-A-gv---kTmVAfNn--i--kTPAall-AKQ-IIarGdIG-----E-PV-rFRg--- 182
JCSG2772641 111 cE-A-gv---VLgtnHHL--R--NAaThra-mRE-aIaAGrIG-----r-PI-aaRv--- 149
JCSG2865669 114 KE-T-gv---kflcGHSs--R--RLgALrK-mKE-MIDTkeIGevssiE-aV-FsN---- 156
JCSG1489517 110 RE-A-gv---VLgtnHHL--R--NAaAhra-mRD-aIaEGrIG-----r-PI-aaRv--- 148
JCSG3192933 140 DE-A-gv---rLFVVKQn--R--RnaTLql-VKK-aIEQGrFG-----r-iy-MVTv--- 178
JCSG3229914 158 DE-S-Da---lfvLTHNY--t--gyPmvrQ-ARE-MIENGdIG-----a-vr-LVQmeyp 199
JCSG2391714 112 KK-A-Dv---iLFtGfNr--R--fdrnFkK-lKE-aVENGTIG-----k-Ph-vLRi--- 150
JCSG2877059 115 EE-K-QR---lLsVfHNr--R--wdsdYlg-iRQ-VIEQGTLG-----a-vk-hFEs--- 153
JCSG221477  198 Ka-A-NK---kLmIGyRc--H--YdPmnra-AvK-LIRENqLG-----k-lg-MVTt--- 236
JCSG217883  146 Ka-A-NK---kLmIGyRc--H--YdPmnra-AvK-LIRENqLG-----k-lg-MVTt--- 184
JCSG470085  152 Ka-A-NK---kLmIGyRc--H--YdPmnra-AvK-LIRENqLG-----k-lg-MVTt--- 190
JCSG214674  117 Ka-A-NK---kLmIGyRc--H--YdPmnra-AvK-LIRENqLG-----k-lg-MVTt--- 155
JCSG2393794 113 KR-v-NK---hfmVhQNr--R--wdedFli-iKE-MfEQkTIG-----E-mf-hLEs--- 151
JCSG3251741 142 ER-S-gK---VAaLGyNY--i--QnPVMrh-iRK-LVgDGVIG-----r-----VN---- 176

QUERY       157 QI---WV-GMD-E---N---NKYVHTDWR-KKPKHV--------G-G--FLSDGGV-HHA 192
JCSG485271  169 QI---WV-GxD-E---N---NKYVHTDWR-KKPKHV--------G-G--FLSDGGV-HHA 204
JCSG3209137 176 SF---tI-ppk-p---Q---G-----DiR-yQadvg--------G-G--aLlDiGV-Ypi 206
JCSG3209138 176 SF---tI-ppk-p---Q---G-----DiR-yQadvg--------G-G--aLlDiGV-fpi 206
JCSG3209140 176 SF---tI-ppk-p---Q---G-----DiR-yQadvg--------G-G--aLlDiGV-Ypi 206
JCSG3209139 176 SF---tI-ppk-p---Q---G-----DiR-yQadvg--------G-G--aLlDiGV-Ypi 206
JCSG3256161 173 aFt--Yf-NrD-a---S---N------mR-NiPElg--------G-G--gLpDiGV-YpV 203
JCSG3254759 183 tF---dq-GF--y---N---DpnLpwSWRcSKtlgg--------S-G--aLGDlGA-Htl 218
JCSG2772641 150 fh---aV-yLp-p---H---lQ----gWRldKPEag--------G-G--vIlDitV-HdA 182
JCSG2865669 157 ----------E-R---G---lElkkgNWR-gEPatAp-------G-G--pLTQlGV-HQi 187
JCSG1489517 149 fh---aV-yLp-p---H---lQ----gWRlERPEag--------G-G--vIlDitV-HdA 181
JCSG3192933 179 NVf--WT-rpQ-E--------yYdaArWR-gKwEwd--------G-G--aFmNqAs-HYV 213
JCSG3229914 200 Qd---WL-teNiE---Q---SgqkQAaWR-tdPaRs--------G-A--ggStGdIgtHA 237
JCSG2391714 151 ts---rd-pap-p---p---ldYIRVS-----------------G-G--IFlDmtI-Hdf 178
JCSG2877059 154 H--------FD-R---f---RpeVRVrWR-EQnvpg--------S-G--LwfDlGp-Hli 185
JCSG221477  237 Dn---sd-vMD-Q---N---Dp--aqQWRlRRelag--------G-G--sLmDiGI-Ygl 271
JCSG217883  185 Dn---sd-vMD-Q---N---Dp--aqQWRlRRelag--------G-G--sLmDiGI-Ygl 219
JCSG470085  191 Dn---sd-vMD-Q---N---Dp--aqQWRlRRelag--------G-G--sLmDiGI-Ygl 225
JCSG214674  156 Dn---sd-vMD-Q---N---Dp--aqQWRlRRelag--------G-G--sLmDiGI-Ygl 190
JCSG2393794 152 RV----------H---G---aNgIpgDWR-hlkaHg--------G-G--MVlDwGV-Hll 182
JCSG3251741 177 HV---rV-eMD-E---DfmaDpdIffyWK-SElSag--------y-G--aLDDfAV-Hpl 215

QUERY       193 AAMRLILG--E--IEWISA-V---AKDL------S-P----------L------L----- 216
JCSG485271  205 AAxRLILG--E--IEWISA-V---AKDL------S-P----------L------L----- 228
JCSG3209137 207 rAagLFLGa-D--LEFVGA-VlrheRDr------D-v----------V------V----- 234
JCSG3209138 207 rAagLFLGa-D--LEFVGA-VlrheRDr------D-v----------V------V----- 234
JCSG3209140 207 rAagLFLGa-D--LEFVGA-VlrheRDr------D-v----------V------V----- 234
JCSG3209139 207 rAagLFLGa-D--LEFVGA-VlrheRDr------D-v----------V------V----- 234
JCSG3256161 204 mStRFstG--K--eplriq-A---ntEr------D-P----------d------F----- 227
JCSG3254759 219 SVaQFLLG--g--IReVTA-s---AQ---------------------------------- 236
JCSG2772641 183 dTLRFVLN--D---DpIEA-V---AiSh------S-a----------g------M----- 205
JCSG2865669 188 dnLQFLLG--p--VarVfn-f---GKpM------y-t----------e------V----- 211
JCSG1489517 182 dTLRFVLN--D---DpaEA-V---AiSh------S-a----------g------M----- 204
JCSG3192933 214 dlLdwLVG--p--VEsVyA-y---TatL------A-r----------r------I----- 237
JCSG3229914 238 ynLgcFVS--g--LE-LEe-L---AaDL------D-s----------F------V----- 260
JCSG2391714 179 dmaRyIMG------EeVEe-V---faDg------S-v----------L------Vdeeig 205
JCSG2877059 186 dqalqLFG--l--pQsVQG-n---iatL------r-d----------g------a----- 209
JCSG221477  272 nGtRyLLG--E---EpIEV-r---Ayty------S-dpnder-----F------V----- 299
JCSG217883  220 nGtRyLLG--E---EpIEV-r---Ayty------S-dpnder-----F------V----- 247
JCSG470085  226 nGtRyLLG--E---EpIEV-r---Ayty------S-dpnder-----F------V----- 253
JCSG214674  191 nGtRyLLG--E---EpIEV-r---Ayty------S-dpnder-----F------V----- 218
JCSG2393794 183 dqLlFLVd--S--n--VKS-V---SaNL------S-f----------a------L----- 204
JCSG3251741 216 SlLwyLFG--H--VE---A-V---itDMvkpypdr-P----------L------s----- 242

QUERY       217 --G--G-------M---DFLSS--I----FEFENG---TVG------NYTI---S----- 239
JCSG485271  229 --G--G-------x---DFLSS--I----FEFENG---TVG------NYTI---S----- 251
JCSG3209137 235 --G--G-------n---aLLTT----------RQG---VTA------QlTF---G----- 253
JCSG3209138 235 --G--G-------n---aLLTT----------RQG---VTA------QlTF---G----- 253
JCSG3209140 235 --G--G-------n---aLLTT----------RQG---VTA------QlTF---G----- 253
JCSG3209139 235 --G--G-------n---aLLTT----------RQG---VTA------QlTF---G----- 253
JCSG3256161 228 --G--t-------d---iYsSv--k----aDFDDf---eLS------fY-V---S----- 249
JCSG3254759 235 ------------------------------------------------------------ 236
JCSG2772641 206 --GkeG-------Le--DgVmG--V----LRFRSG---VIA------QFhd---A----- 231
JCSG2865669 212 --e--N-------I---tvnQT--L----LEFEDG---kqA------ylgt---N----- 234
JCSG1489517 205 --G--kegv----e---DgVmG--V----LRFQSG---VIA------QFhd---A----- 230
JCSG3192933 238 --e--A-------e---DtgvA--a----LRWRHG---AMG------SiNVtmlT----- 263
JCSG3229914 261 --G--G------------------------------------------------------ 262
JCSG2391714 206 kaG--d-------V---Dtavv--V----LRFKSG---ALG--------VI---D----- 228
JCSG2877059 210 --e--i-------n---DWahv--V----LNYpah---kVi------lHcs---m----- 232
JCSG221477  300 --e--v-------e---DrIiw--q----MRFRSG---ALS------HgAs---S----- 322
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QUERY       258 --------------SIS-------W-------------------------D----K---- 263
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JCSG3209138 286 -VV--------h-----iErqdha--------E---Q----------F-v---LPaHDQF 306
JCSG3209140 286 -VV--------h-----iErqdha--------E---Q----------F-v---LPaHDQF 306
JCSG3209139 286 -VV--------h-----iErqdha--------E---Q----------F-v---LPaHDQF 306
JCSG3256161 283 -Ie--------LadrshNE-------------S---R----------IfR---fqDSRQY 304
JCSG3254759 235 ------------------------------------------------------------ 236
JCSG2772641 264 vVL--------r-----NE-------------EgesE----------L-p---LdHRNlY 283
JCSG2865669 288 -rI--------L-----RD-------------v---K----------V-d---feSvDhl 303
JCSG1489517 259 -pVgtvtlrnae-----GE-------------S---Q----------L-p---LdpaNlY 282
JCSG3192933 282 ------------------------------------------------------------ 283
JCSG3229914 261 ------------------------------------------------------------ 262
JCSG2391714 260 -VV--------L-----TD-------------E---QgdrgsrylyfF-l---eryRDSY 285
JCSG2877059 280 -LV--------I-----yD-------------a---S----------L-Q---AhaQaTp 295
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JCSG217883  300 -LIsvqtpgh-a-----NQ-------------S---m----------M-pqfiMPaNNQF 325
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JCSG2393794 253 ------------------------------------------------------------ 254
JCSG3251741 298 -er--------M-----NE-------------f---E----------L------------ 305

QUERY       280 QKEF--------EDFY-QVV-AEG-K-PNDLGS---P-VQALKDLAFIEACVRSAGNKVF 323
JCSG485271  292 QKEF--------EDFY-QVV-AEG-K-PNDLGS---P-VQALKDLAFIEACVRSAGNKVF 335
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JCSG3209138 307 aKSI--------RaFa-QAV-lSG-EhPREwSE------DSLRQaSLVDA-VRTGARdIY 348
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JCSG3209139 307 aKSI--------RaFa-QAV-lSG-EhPREwSE------DSLRQaSLVDA-VRTGARdIY 348
JCSG3256161 305 RREv--------EaFa-RAV-eNG-K---------------------------------- 319
JCSG3254759 235 ------------------------------------------------------------ 236
JCSG2772641 284 EtaI--------aaFH-SAIgGNG-R-PSasG---------------------------- 304
JCSG2865669 304 RvEv--------EEva-DVI-rNG-g-eTEIGA---e-A-SLRNLAvVlAAVKSVhEK-- 344
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JCSG3192933 282 ------------------------------------------------------------ 283
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JCSG2391714 286 lEEL--------KtFi-KnV-kSG-E-P-------------------------------- 301
JCSG2877059 296 QgDq--------RQYY-MLI-rDA-l-kGQIANpvpP-VEALavMAvLEAAVRSA----- 337
JCSG221477  378 SaQL--------DhLa-EAV-iNN-K-P--VrS---PgeEGMQDVrLIQAiyEAA----- 415
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QUERY       324 VSSLL 328
JCSG485271  336 VSSLL 340
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JCSG2393794 253 ----- 254
JCSG3251741 304 ----- 305

Note
Homologous search is done using BLAST from NCBI BLAST against database pdbnr with expect (E-value cut-off) at 0.001. The structure of a PDB sequence may be fully or partly solved. The non-redundant database pdbnr consists of unique PDB sequences from the representative PDB chains. Each representative chain has the best structural coverage in the set of the same sequences. You could click a sequence ID to see all of PDB chains associated with the sequence ID plus sequence alignments and structural coverages.



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