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   TM0006;TM0006
Protein Sequence Comparative Analysis   (PSCA)
 
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TM0006    PDB Fold Similairty





PDB sequences with significant alignments
Sequence information                                           Score	E-value
JCSG39803|pdb|3DEQ_A|Muconate cycloisomerase                      667	0.0
JCSG3227132|pdb|3S5S_A|Mandelate racemase/muconate lactoniz...    199	1e-51
JCSG3227176|pdb|3U9I_B|Mandelate racemase/muconate lactoniz...    192	2e-49
JCSG73909|pdb|1JPM_A|L-Ala-D/L-Glu Epimerase                      191	5e-49
JCSG1663923|pdb|3IK4_B|Mandelate racemase/muconate lactoniz...    188	3e-48
JCSG360127|pdb|3JZU_A|Dipeptide Epimerase                         173	1e-43
JCSG3194664|pdb|3R0U_B|Enzyme of enolase superfamily              156	2e-38
JCSG729891|pdb|3Q45_A|Mandelate racemase/muconate lactoniz...     155	4e-38
JCSG1663888|pdb|3RIT_A|Dipeptide epimerase                        154	9e-38
JCSG1578867|pdb|2P88_A|Mandelate racemase/muconate lactoniz...    144	9e-35
JCSG3172743|pdb|3IJQ_A|Muconate cycloisomerase                    126	2e-29
JCSG1667777|pdb|3I4K_A|Muconate lactonizing enzyme                102	3e-22
JCSG3172462|pdb|3MY9_A|Muconate cycloisomerase                    97	1e-20
JCSG1559365|pdb|2QDE_A|Mandelate racemase/muconate lactoniz...    96	2e-20
JCSG220396|pdb|3MUC_A|PROTEIN (MUCONATE CYCLOISOMERASE)           95	5e-20
JCSG220100|pdb|2MUC_A|PROTEIN (MUCONATE CYCLOISOMERASE)           95	5e-20
JCSG2986285|pdb|3DG7_B|Muconate cycloisomerase                    95	5e-20
JCSG217665|pdb|1MUC_A|MUCONATE LACTONIZING ENZYME                 95	5e-20
JCSG2998075|pdb|3I6E_F|Muconate cycloisomerase I                  95	6e-20
JCSG3240699|pdb|4DYE_A|isomerase                                  57	2e-08
...more
PDB sequence alignments
QUERY       1   MSRIVNVKLSLKRYEYEKPFH---I-TGS-VSSESRN-VE-VEIVL-----E-SGVKGYG 47
JCSG39803   1   MSRIVNVKLSLKRYEYEKPFH---I-TGS-VSSESRN-VE-VEIVL-----E-SGVKGYG 47
JCSG3227132 21  -----------------EPFg---I-AGG-AQERAaN-Ll-VtVeL-----a-DGTlGFG 50
JCSG3227176 43  -----------------EPFg---I-ASG-AQEvARN-Ll-VaVeL-----t-DGTRGYG 72
JCSG73909   2   --KIIRIEtSriavpltKPFk---t-Alr-TvytAES-Vi-VRITy-----D-SGAvGWG 46
JCSG1663923 21  -----------------EPFa---I-ASG-AQAvAaN-Vl-VKVqL-----a-DGTlGlG 50
JCSG360127  2   --KIkQVhVraSKiKlKEtFt---I-AlG-TiESAdS-Ai-VEIet-----E-EGLvGYG 46
JCSG3194664 2   VSKIIDIKtSIiKiplKRtFi---t-Avr-sTNHidS-La-VELTL-----D-NGVKGYG 48
JCSG729891  3   ---ITQVELykSpvKlKEPFk---I-SlG-IlTHANN-Vi-VRIht-----a-SGhiGYG 46
JCSG1663888 2   --KIADIQVrtEHFpltRPYR---I-Afr-siEEidN-Li-VEIrt-----a-DGLlGlG 46
JCSG1578867 2   --KITaIhLyaiRlplRNPFv---I-SyG-sySDmpS-Ii-VKMet-----D-EGIiGYG 46
JCSG3172743 1   ------MKMTFfpYElKlrhv---F-TvA-TySRTtT-pD-VQVeI-----EyEGVtGYG 42
JCSG1667777 13  -SRILDVpLi-------RPhg---F-AtT-TSTEQHi-Ll-VSVhL-----E-NGViGYG 51
JCSG3172462 29  ---------------------------GN-VKGSvKR-Vl-LEVTs-----a-DGIvGWG 52
JCSG1559365     ------------------------------------------------------------
JCSG220396  17  -----------------RPhk---L-Amh-TmQQQtl-Vv-LRVrc-----S-DGVEGiG 46
JCSG220100  20  -----------------RPhk---L-Amh-TmQQQtl-Vv-LRVrc-----S-DGVEGiG 49
JCSG2986285 15  ---------------YtKPLR---F-ASG-evhaAEH-Vl-VRVht-----D-DGIvGvA 46
JCSG217665  20  -----------------RPhk---L-Amh-TmQQQtl-Vv-LRVrc-----S-DGVEGiG 49
JCSG2998075 28  --------------------H---g-iGr-VEGScEi-Vv-LRLVa-----E-GGAEGFG 54
JCSG3240699 23  MmKITDVdVwVvNlplvNPFt---s-SfE-TKTgEtR-Tv-VRVrt-----D-SGVEGWG 69

QUERY       48  E----A-----------S----P----SF--R---VN--G-E-RV-----E-AL-L--A- 65
JCSG39803   48  E----A-----------S----P----SF--R---VN--G-E-RV-----E-AL-L--A- 65
JCSG3227132 51  E----A-----------A----P----lp--a---fN--G-E-tq-----D-Gs-r--A- 68
JCSG3227176 73  E----A-----------A----P----fp--a---fN--G-E-tq-----D-ma-h--A- 90
JCSG73909   47  E----A-----------p----P----TL--v---IT--G-D-sM-----D-SIes--A- 65
JCSG1663923 51  E----A-----------A----P----fp--a---VS--G-E-tq-----t-Gt-s--A- 68
JCSG360127  47  E----G-----------G----P----GI--f---IT--G-E-tL-----a-Gt-L--e- 64
JCSG3194664 49  v----A-----------p----a----Tt--a---IT--G-D-tL-----Q-GMqy--i- 67
JCSG729891  47  E----C-----------S----P----fM--t---IH--G-E-sM-----D-Ta-F--i- 64
JCSG1663888 47  a----A-----------S----P----Er--H---VT--G-E-tL-----E-Acha--A- 65
JCSG1578867 47  E----G-----------v----a----Dd--H---VT--G-E-sw-----E-St-Fh-T- 65
JCSG3172743 43  E----A-----------Sm---P----pY--l-------G-E-tV-----E-SV-M---- 58
JCSG1667777 52  E----Gvvpg-------G----P----wW-------G--G-E-sV-----E-TM-k--Al 72
JCSG3172462 53  E----A-----------A----P----we--v---fT--G-t-pe-----a-AF-s--A- 70
JCSG1559365     ------------------------------------------------------------
JCSG220396  47  E----A-----------T----tvg--GL--a---yG--y-E-sp-----E-GI-k--An 67
JCSG220100  50  E----A-----------T----tig--GL--a---yG--y-E-sp-----E-GI-k--An 70
JCSG2986285 47  E----A-----------p----P----rp--f---Ty--G-E-tq-----t-GI-V--Av 65
JCSG217665  50  E----A-----------T----tig--GL--a---yG--y-E-sp-----E-GI-k--An 70
JCSG2998075 55  E----A-----------S----P----wa--v---fT--G-t-pe-----a-Sy-a--A- 72
JCSG3240699 70  E----T-----------------------------Mw--G-a-pV-----a-AI------ 80

QUERY       66  I-ENAVREMI--T----G---I------DVRN-----Y-A----RIF-E----------- 87
JCSG39803   66  I-ENAVREMI--T----G---I------DVRN-----Y-A----RIF-E----------- 87
JCSG3227132 69  a-avSLREaV--V----G---s------DARa-----W-r----aVa-R----------- 90
JCSG3227176 91  a-ilAARSLV--e----G---a------DVRE-----W-r----RIa-l----------- 112
JCSG73909   66  I-HHVLKpaL--l----G---k------SLaG-----Y-e----aILhD----------- 88
JCSG1663923 69  a-iErLQShL--l----G---a------DVRG-----W-r----KLa-a----------- 90
JCSG360127  65  t-iElfgQaI--i----G---L------NpfN-----i-e----KIh-E----------- 86
JCSG3194664 68  I-REifapVI--l----G---s------DLsD-----Y-k----QtL-E----------- 89
JCSG729891  65  V-gQyLaKgL--i----G---t------SclD-----i-V----sns-l----------- 86
JCSG1663888 66  L-DHdrlgwL--m----G---r------DIRT-----l-p----RLcrE----------- 88
JCSG1578867 66  L-KHTLtpaL--i----G---q------NpmN-----i-e----KIh-D----------- 87
JCSG3172743 59  -------NFL--k----k---V------NLEQ-----F-S----dpF-Q----------- 74
JCSG1667777 73  V-DGyLapVL--i----G---r------aVsE-----l-A----gIM-a----------- 94
JCSG3172462 71  L-DiyLRpLI--l----G---a------pIKR-----v-r----ELM-a----------- 92
JCSG1559365     ------------------------------------------------------------
JCSG220396  68  I-DahLapaL--i----G---L------aAdN-----i-n----aaM-l----------- 89
JCSG220100  71  I-DahLapaL--i----G---L------aAdN-----i-n----aaM-l----------- 92
JCSG2986285 66  I-EQyfapaL--i----G---L------tLtE-----r-e----vah-t----------- 87
JCSG217665  71  I-DahLapaL--i----G---L------aAdN-----i-n----aaM-l----------- 92
JCSG2998075 73  L-DRyLRpLV--i----G---r------rVgD-----r-V----aIM-D----------- 94
JCSG3240699 81  V-RRmApDLIgtS----p---F------aLEa-----F-h----Rkq-H----------- 104

QUERY       88  -I-T--------D--R----L--------F------G------------F------P--- 96
JCSG39803   88  -I-T--------D--R----L--------F------G------------F------P--- 96
JCSG3227132 91  -a-l--------r--E----a--------s------Ggg----------a------g--- 101
JCSG3227176 113 -a-l--------p--a----L--------p------G------------M------tg-- 122
JCSG73909   89  -I-q--------h--l----L--------t------G------------n------m--- 97
JCSG1663923 91  -M-l--------D--H----ae-------h------e------------a------a--- 100
JCSG360127  87  -V-m--------D--K----I--------s------A------------Fa-----P--- 96
JCSG3194664 90  -L-A--------f--K----k--------v------m------------F------n--- 98
JCSG729891  87  -L-m--------D--a----Ii-------Y------G------------n------s--- 96
JCSG1663888 89  -L-A--------E--R----L--------p------A------------a------P--- 97
JCSG1578867 88  -M-m--------D--Nt---I--------Y------G------------v------P--- 97
JCSG3172743 75  -L-e--------D--i----L--------s------y------------v------d--- 83
JCSG1667777 95  -d-l--------E--R----V--------v------A------------r------a--- 103
JCSG3172462 93  -r-m--------D--Km---L--------v------G------------h------g--- 102
JCSG1559365     ------------------------------------------------------------
JCSG220396  90  -k-l--------D--K----L--------ak-----G------------n------t--- 99
JCSG220100  93  -k-l--------D--K----L--------ak-----G------------n------t--- 102
JCSG2986285 88  -r-m--------a--R----t--------v------G------------n------P--- 96
JCSG217665  93  -k-l--------D--K----L--------ak-----G------------n------t--- 102
JCSG2998075 95  -e-A--------a--R----a--------v------A------------hc-----t--- 104
JCSG3240699 105 -M-V--------p--f----F--------Y------G------------Y------l--- 113

QUERY       97  S----------L-------K------------A--A---V------Q-FATLDALSQE-- 113
JCSG39803   97  S----------L-------K------------A--A---V------Q-FATLDALSQE-- 113
JCSG3227132 102 A----------a-------R------------C--A---I------E-tAiLDALTKR-- 118
JCSG3227176 123 S----------a-------R------------C--A---I------E-tAiLDALTRR-- 139
JCSG73909   98  S----------a-------K------------A--A---V------E-MAlyDGwAQm-- 114
JCSG1663923 101 A----------a-------R------------C--G---L------E-MAmLDALTRH-- 117
JCSG360127  97  A----------a-------K------------A--A---I------D-IAcyDlMGQK-- 113
JCSG3194664 99  S----------aa------K------------m--A---I------D-LAyhDlLAKE-- 116
JCSG729891  97  c----------I-------K------------S--A---f------N-IAlyDlaAQH-- 113
JCSG1663888 98  A----------a-------R------------A--A---L------D-MAlhDlVAQc-- 114
JCSG1578867 98  T----------a-------K------------A--A---I------D-IAcFDiMGKK-- 114
JCSG3172743 84  S----------LspkdtaaK------------A--A---V------D-IAlhDlVGKl-- 107
JCSG1667777 104 r----------ya------K------------A--A---V------D-vAmhDAwARS-- 121
JCSG3172462 103 E----------a-------K------------A--A---V------E-MAlLDiLGKa-- 119
JCSG1559365 104 -------------------K------------A--T---V------D-FAlhDlVGKR-- 118
JCSG220396  100 f----------a-------K------------S--G---I------E-sAlLDAqGKR-- 116
JCSG220100  103 f----------a-------K------------S--G---I------E-sAlLDAqGKR-- 119
JCSG2986285 97  T----------a-------K------------A--A---I------D-MAmwDALGQS-- 113
JCSG217665  103 f----------a-------K------------S--G---I------E-sAlLDAqGKR-- 119
JCSG2998075 105 E----------a-------K------------A--A---L------D-sAlLDlaGRi-- 121
JCSG3240699 114 G----------y-------a------------AiaA---V------D-vAcwDAMGKa-- 132

QUERY       114 -------------L--------GTQVC-YLLGG------------K---R----D-E--- 128
JCSG39803   114 -------------L--------GTQVC-YLLGG------------K---R----D-E--- 128
JCSG3227132 119 -------------a--------GmpLw-aFFGG------------S---g----t-a--- 133
JCSG3227176 140 -------------a--------rlpLw-aFFGG------------a---a----t-S--- 154
JCSG73909   115 -------------c--------GlpLy-qMLGG------------y---R----D-t--- 129
JCSG1663923 118 -------------y--------hmpLh-vFFGG------------v---s----k-Q--- 132
JCSG360127  114 -------------a--------qlpLy-qLLGG------------y---d----N-Q--- 128
JCSG3194664 117 -------------q--------diSVA-kLLGA------------K---a----N-S--- 131
JCSG729891  114 -------------a--------GlpLy-aFLGG------------K---K----D-K--- 128
JCSG1663888 115 -------------L--------GlpLv-eILGr------------a---H----D-S--- 129
JCSG1578867 115 -------------L--------NqpVy-qLIGG------------Ry--H----E-E--- 130
JCSG3172743 108 -------------L--------GApwy-kIwGl------------N---K----E-K--- 122
JCSG1667777 122 -------------L--------NVpVr-dLLGG------------tv--R----D-K--- 137
JCSG3172462 120 -------------t--------GlSVA-dLLGG------------Rv--R----D-R--- 135
JCSG1559365 119 -------------F--------GVpVy-qLLGG------------K---t----i-Er-- 134
JCSG220396  117 -------------L--------GlpVs-eLLGG------------Rv--R----D-S--- 132
JCSG220100  120 -------------L--------GlpVs-eLLGG------------Rv--R----D-S--- 135
JCSG2986285 114 -------------L--------rlSVs-eMLGG------------y---t----D-R--- 128
JCSG217665  120 -------------L--------GlpVs-eLLGG------------Rv--R----D-S--- 135
JCSG2998075 122 -------------s--------NlpVw-aLLGG------------Kc--R----D-t--- 137
JCSG3240699 133 -------------t--------GqSVt-dLLGG------------av--R----D-E--- 148

QUERY       129 I----------------E-----T----------D-K---T-V--------G------I- 137
JCSG39803   129 I----------------E-----T----------D-K---T-V--------G------I- 137
JCSG3227132 134 L----------------t-----T----------D-i---T-I--------t------t- 142
JCSG3227176 155 L----------------E-----T----------D-v---T-I--------t------t- 163
JCSG73909   130 L----------------E-----T----------D-y---T-V--------S------V- 138
JCSG1663923 133 L----------------E-----T----------D-m---T-I--------t------a- 141
JCSG360127  129 V----------------i-----T----------D-i---T-L--------G------I- 137
JCSG3194664 132 I----------------v-----T----------D-v---S-I--------S------c- 140
JCSG729891  129 Ii---------------Q-----T----------D-y---T-V--------S------I- 138
JCSG1663888 130 L----------------p-----T----------S-v---T-I--------G------I- 138
JCSG1578867 131 F----------------p-----V----------t-h---V-L--------S------I- 139
JCSG3172743 123 tp---------------S-----T----------t-f---T-I--------G------I- 132
JCSG1667777 138 V----------------D-----V----------t-w---A-L--------G------V- 146
JCSG3172462 136 I----------------p-----l----------S-f---S-I--------A------d- 144
JCSG1559365 135 I----------------p-----l----------g-l---V-L--------G------a- 143
JCSG220396  133 L----------------E-----V----------a-w---T-L--------A------s- 141
JCSG220100  136 L----------------E-----V----------a-w---T-L--------A------s- 144
JCSG2986285 129 M----------------R-----V----------S-h---m-L--------G------F- 137
JCSG217665  136 L----------------E-----V----------a-w---T-L--------A------s- 144
JCSG2998075 138 I----------------p-----l----------S-c---S-I--------A------n- 146
JCSG3240699 149 Vpitalitra-------D-----A----------p-g---A-T--------p------a- 166

QUERY       138 -----D--T---V--------------EN-RVK-E-AKKIF-E-E----G-FRVIKI--- 160
JCSG39803   138 -----D--T---V--------------EN-RVK-E-AKKIF-E-E----G-FRVIKI--- 160
JCSG3227132 143 -----g--S---p--------------ER-aeE-a-ARRaa-a-m----G-FRALKV--- 165
JCSG3227176 164 -----g--S---V--------------ta-aAR-a-AQaIv-a-R----G-vtTIKI--- 186
JCSG73909   139 -----N--S---p--------------EE-mAa-D-AENyL-K-Q----G-FQTLKI--- 161
JCSG1663923 142 -----g--d---e--------------vH-aAa-S-AKaIL-a-R----G-IKsIKV--- 164
JCSG360127  138 -----D--e---p--------------Nv-mAQ-K-AvEkv-K-l----G-FdTLKI--- 160
JCSG3194664 141 -----g--N---V--------------aE-tIQ-N-iQNgv-E-a----N-FtAIKV--- 163
JCSG729891  139 -----D--e---p--------------HK-mAa-D-AvQIk-K-N----G-FEIIKV--- 161
JCSG1663888 139 -----k--p---V--------------EE-tLa-E-AREhL-a-l----G-FRVLKV--- 161
JCSG1578867 140 -----a--d---p--------------EN-mAE-E-AaSMI-Q-K----G-YQsFKM--- 162
JCSG3172743 133 -----D--TpdvV--------------Ra-KTK-E-CagLF-N----------ILKV--- 154
JCSG1667777 147 -----l--p---L--------------Dv-aVa-E-iEErI-E-Ef---G-nRsFKL--- 170
JCSG3172462 145 -----p--d---f--------------Da-dLE-R-mRaMv-p-a----G-htVFKM--- 167
JCSG1559365 144 -----g--e---p--------------Ea-vAE-E-AlaVL-R-E----G-FHfVKL--- 166
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JCSG220100  145 -----g--d---T--------------aR-dIa-E-ARhML-EiR----r-hRVFKL--- 168
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QUERY       165 ---------N-L------K--------------E-DIEA----V----EEI--A-K-V-T 180
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JCSG3227132 170 ---------R-L------aa-------------S-Dpar----I----EaI--h-a-A-A 186
JCSG3227176 200 ---------T-M------E--------------H-DLar----I----vaI--r-d-V-A 215
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JCSG2998075 175 ---------D-h------a--------------f-DImr----L----ElI--A-R-d-f 190
JCSG3240699 195 ---------D-c------a--------------g-DVai----L----RaV--r-E-A-l 210

QUERY       181 R-----G--A-----K-----Y-------------------------------------- 185
JCSG39803   181 R-----G--A-----K-----Y-------------------------------------- 185
JCSG3227132 187 p-----G--A-----S-----l-------------------------------------- 191
JCSG3227176 216 p-----t--A-----R-----l-------------------------------------- 220
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JCSG3172743 173 ------d--l-----p-----i-------------------------------------- 176
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JCSG39803   186 -I-------V--DA-NMG-----YTQ-KE-A----VEFARAVYQ----------K----- 208
JCSG3227132 192 -I-------L--DG-NgG-----lTa-gE-A----LaLVahArR----------l----- 214
JCSG3227176 221 -I-------L--DG-NcG-----YTa-pD-A----LRLldmLgv----------h----- 243
JCSG73909   189 -r-------L--DA-NQG-----Wrp-KE-A----VtaiRkMeD----------a----- 211
JCSG1663923 191 -I-------V--DG-NcG-----Ydv-ER-A----LaFCaAcka----------E----- 213
JCSG360127  187 -r-------L--DA-NQA-----WTp-KD-A----VKaiQALaD----------y----- 209
JCSG3194664 190 -r-------f--DA-NQG-----WNl-aQ-T----kQFiEeInK----------y----- 212
JCSG729891  187 -Lr------I--DA-NQG-----WSv-Et-A----IEtltlL------------E----- 208
JCSG1663888 187 -Vr------V--Dp-NQS-----YdR-dg-l----LRLdRlVqE----------l----- 210
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JCSG3172743 177 -a-------V--DA-NQG-----WkD-RQyA----LDMiHwLkE----------K----- 200
JCSG1667777 198 -r-------I--Di-Nar-----WdR-Rt-A----LHYlpiLaE----------a----- 220
JCSG3172462 193 -d-------LrlDf-NQA-----lTp-fg-A----MKIlRdV------------d----- 215
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JCSG220396  193 -r-------V--DV-NQy-----WdE-SQ-A----IRaCQVLgD----------N----- 215
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JCSG2986285 189 -y-------V--DG-NrG-----WSa-aE-S----LRamReM------------a----- 209
JCSG217665  196 -r-------V--DV-NQy-----WdE-SQ-A----IRaCQVLgD----------N----- 218
JCSG2998075 196 -r-------V--Dy-NQG-----lei-dE-A----VprVldVaQ----------f----- 218
JCSG3240699 216 -r-------V--Dp-NaA-----WSv-pD-S----VRaGiALeE---------------- 237

QUERY       209 ----G-I----------------------------------------DIA---V--Y--- 215
JCSG39803   209 ----G-I----------------------------------------DIA---V--Y--- 215
JCSG3227132 215 ----G-a----------------------------------------DVA---L--l--- 221
JCSG3227176 244 ----G-I----------------------------------------vpA---L--F--- 250
JCSG73909   212 ----G-L----------------------------------------gIe---L--v--- 218
JCSG1663923 214 ----S-I----------------------------------------pMV---L--F--- 220
JCSG360127  210 ----q-I----------------------------------------ELV---------- 214
JCSG3194664 213 ----S-L----------------------------------------NVe---I--i--- 219
JCSG729891  209 ----p-y----------------------------------------NIq---h--c--- 215
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JCSG1578867 210 ----GhL----------------------------------------NId---w--i--- 217
JCSG3172743 201 ----G-I------------------------------------------V---M--i--- 205
JCSG1667777 221 ----G-V----------------------------------------EL-------F--- 225
JCSG3172462 216 ----A-F----------------------------------------rpT---f--i--- 222
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JCSG220396  216 ----G-I----------------------------------------DLi---------- 220
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JCSG2986285 210 ----d-L----------------------------------------DLl---f--a--- 216
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JCSG2998075 219 ----q-p----------------------------------------DFi---------- 223
JCSG3240699 238 ------L----------------------------------------DLe---y--l--- 243

QUERY       216 --EQPVR--R-EDIEGLKFVRFH-SPF-PVAADESARTK-FDVMRLVKE-EAV-DYV-NI 264
JCSG39803   216 --EQPVR--R-EDIEGLKFVRFH-SPF-PVAADESARTK-FDVMRLVKE-EAV-DYV-NI 264
JCSG3227132 222 --EQPVp--R-DDwDGMKeVtrR-Agv-dVAADESAaSa-eDVLRVAaE-RAA-tvV-NI 270
JCSG3227176 251 --EQPVa--K-DDeEGLRrLtat-rrv-PVAADESVaSa-tDAaRLARN-aAV-DvL-NI 299
JCSG73909   219 --EQPVH--K-DDLaGLKkVtda-Tdt-PImADESVfTp-rQAFEVLQt-RSA-DlI-NI 267
JCSG1663923 221 --EQPLp--R-EDwaGMaqVtaQ-SgF-aVAADESARSa-hDVLRIARE-gTA-SvI-NI 269
JCSG360127  215 --EQPVK--R-RDLEGLKYVtsQ-vnt-tImADESCfda-qDALELVKK-gTV-DvI-NI 263
JCSG3194664 220 --EQPVK--y-yDIKAMaeItkf-SnI-PVVADESVfda-kDAeRVIdE-QAc-NmI-NI 268
JCSG729891  216 --EEPVs--R-NlytALpkIRqa-crI-PImADESCcNS-FDAeRLIQi-QAc-Dsf-NL 264
JCSG1663888 216 --EQPfp--a-grtDwLRaLpka-irr-rIAADESllgp-aDAFaLAap-pAAcgif-NI 265
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JCSG3172743 206 --EQPMp--K-EQLDdIaWVtqQ-SPL-PVfADESlQrl-gDVaaL--K-gAf-tgI-NI 252
JCSG1667777 226 --EQPTp--a-DDLEtLReItrR-Tnv-sVmADESVwTp-aEALaVVKa-QAA-DvI-aL 274
JCSG3172462 223 --EQPVp--R-RhLDAMagfaaa-ldt-PIlADESCfda-vDLMEVVRR-QAA-DaI-SV 271
JCSG1559365 221 --EQPLp--a-wDLDGMarLRgk-vat-PIyADESAQel-hDLLaIINK-gAA-DgL-mI 269
JCSG220396  221 --EQPIs--R-iNrgGqvrLNqR-TPa-PImADESiESv-eDAFsLAaD-gAA-Sif-aL 269
JCSG220100  224 --EQPIs--R-iNrgGqvrLNqR-TPa-PImADESiESv-eDAFsLAaD-gAA-Sif-aL 272
JCSG2986285 217 --EElcp--a-DDVlSrRrLvgQ-ldM-PfiADESVpTp-aDVtReVlg-gSA-taI-SI 265
JCSG217665  224 --EQPIs--R-iNrgGqvrLNqR-TPa-PImADESiESv-eDAFsLAaD-gAA-Sif-aL 272
JCSG2998075 224 --EQPVR--a-HhFElMarLRgl-Tdv-PLlADESVygp-eDMVRaAhE-gic-DgV-SI 272
JCSG3240699 244 --EDPc-----vgIEGMaqVKak-vrI-PLCTNmcVvrf-eDfapaMRl-NAV-DvI-Hg 290

QUERY       265 -K-L-M-K-S-G-ISDA-LAIVEIA---ESSGL-KLMIGC---MG-E-SS---LG---IN 301
JCSG39803   265 -K-L-M-K-S-G-ISDA-LAIVEIA---ESSGL-KLMIGC---MG-E-SS---LG---IN 301
JCSG3227132 271 -K-L-M-K-G-G-IAEA-LdIAaVA---RAAGL-gLMIGg---Mv-E-Sv---LA---MT 307
JCSG3227176 300 -K-L-M-K-c-G-IvEA-LdIAaIA---RTAGL-hLMIGg---Mv-E-Sl---LA---MT 336
JCSG73909   268 -K-L-M-K-AgG-ISgA-ekInaMA---EAcGV-EcMVGs---Mi-E-TK---LG---IT 305
JCSG1663923 270 -K-L-M-K-A-G-VAEG-LkMIaIA---QAAGL-gLMIGg---Mv-E-Si---LA---MS 306
JCSG360127  264 -K-L-M-KcG-G-IhEA-LkInQIC---ETAGI-EcMIGC---MAeE-TT---IG---IT 302
JCSG3194664 269 -K-L-a-K-TgG-IlEA-qkIkKLA---DSAGI-ScMVGC---Mm-E-Sp---aG---Il 306
JCSG729891  265 -K-L-s-K-SaG-ITNA-LnIIRLA---EQAhM-pVQVGg---Fl-E-Sr---LG---FT 302
JCSG1663888 266 -K-L-M-KcG-G-LApA-rrIAtIA---ETAGI-dLMwGC---Md-E-Sr---IS---Ia 303
JCSG1578867 267 -K-L-M-KcG-G-IypA-VkLAHqA---EmAGI-EcQVGs---Mv-E-SS---VA---sS 304
JCSG3172743 253 -K-L-M-KcT-G-MrEA-wkMVtLA---HAlGM-RVMVGC---Mt-E-TS---cA---IS 290
JCSG1667777 275 -K-t-t-KhG-G-LlES-kkIAaIA---EAGGL-achgAt---sl-E-Gp---IG---ta 312
JCSG3172462 272 -K-I-M-KcG-G-LmkA-qSLMaIA---DTAGL-pgygGt---Lw-E-GG---IA---La 309
JCSG1559365 270 -K-t-Q-K-AgG-LlkA-qrwLtLA---RlANL-pVIcGC---Mv-g-SG---Le---aS 307
JCSG220396  270 -K-I-a-K-N-G-gprAvLrtAQIA---EAAGI-gLygGt---Ml-E-GS---IG---tl 307
JCSG220100  273 -K-I-a-K-N-G-gprAvLrtAQIA---EAAGI-gLygGt---Ml-E-GS---IG---tl 310
JCSG2986285 266 -K-t-a-R-T-G-FTgS-trVhHLA---EGlGL-dMVMGn---Qi-D-GQ---IG---ta 302
JCSG217665  273 -K-I-a-K-N-G-gprAvLrtAQIA---EAAGI-gLygGt---Ml-E-GS---IG---tl 310
JCSG2998075 273 -K-I-M-K-SgG-LTrA-qTVARIA---aAhGL-maygGd---Mf-E-AG---LA---hl 310
JCSG3240699 291 -d-V-y-KwG-G-IAaT-kALAahC---ETfGL-gMnLhs---gG-E------LG---Ia 326

QUERY       302 Q---SV---HFAL-----------GT---G-----AF----EF-H------D-LDSHLML 324
JCSG39803   302 Q---SV---HFAL-----------GT---G-----AF----EF-H------D-LDSHLML 324
JCSG3227132 308 a---SA---cFAa-----------Gl---G-----GF----SF-v------D-LDTpLFL 330
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JCSG73909   306 a---AA---HFAa-----------Sk---r-----nI----tr-f------D-FDApLML 328
JCSG1663923 307 f---SA---NLAa-----------GN---G-----GF----DF-i------D-LDTpLFI 329
JCSG360127  303 a---AA---HLAa-----------Aq---k-----nI----tr-a------D-LDA---- 321
JCSG3194664 307 a---TA---sFAL-----------Ae---d------I----tv-a------D-LDpldwV 328
JCSG729891  303 a---AA---HvAL-----------vS---k-----TI----cY-Y------D-FDTpLMF 325
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JCSG1578867 305 a---Gf---HvAF-----------Sk---k-----iI----ts-v------E-LtGpLkF 327
JCSG3172743 291 a---As---QF--------------S---p-----Av----DF-a------D-LDGNLLI 310
JCSG1667777 313 a---SL---QFAa-----------ST---k-----AI----SY----------------- 326
JCSG3172462 310 a---GT---QLia-----------AT---p-----GIslgcEF-Y---------mpHhVL 334
JCSG1559365 308 p---AA---HLlaandwiaqfpqeNA---G-----pL----HI-HdclnsrD-IDNdIaL 347
JCSG220396  308 a---SA---HafL-----------tl---r-----qL----tWgt------E-LfGpLLL 331
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JCSG2998075 311 a---GT---HMia-----------AT---p-----eItlgcEF-Y---------QAsyFL 335
JCSG3240699 327 t---AA---HLAV----------------------------------------------- 333

QUERY       325 KEEVFRGKFI--QDGPRMRVKDQ 345
JCSG39803   325 KEEVFRGKFI--QDGPRMRVKDQ 345
JCSG3227132 331 aENpFdGgFV--QrGPaLsLE-- 349
JCSG3227176 360 aENpFdGgMt--yhG-------- 372
JCSG73909   329 KtDVFNGgIt--ySG-------- 341
JCSG1663923 330 aEHpFiGgFa--QtGgtLQLaD- 349
JCSG360127  320 ----------------------- 321
JCSG3194664 329 aKDLYsdyIt--fNePNIiLKD- 348
JCSG729891  326 EaDpvRGgIV------------- 335
JCSG1663888 327 aRDVaEGgFI--lEdgRLRVtER 347
JCSG1578867 328 tKDI--GNLh--yDvPfIRLNEK 346
JCSG3172743 311 SNDrFKGveV--vNG-------- 323
JCSG1667777 325 ----------------------- 326
JCSG3172462 335 tEDVLEeRIa--NSAgHViVpD- 354
JCSG1559365 348 NvprFEGgYLypNDGPgLgIE-- 368
JCSG220396  332 tEEI------------------- 335
JCSG220100  335 tEEI------------------- 338
JCSG2986285 311 ----------------------- 312
JCSG217665  335 tEEI------------------- 338
JCSG2998075 336 NEDILEtpFr--vEAgQViVpD- 355
JCSG3240699 332 ----------------------- 333

Note
Homologous search is done using BLAST from NCBI BLAST against database pdbnr with expect (E-value cut-off) at 0.001. The structure of a PDB sequence may be fully or partly solved. The non-redundant database pdbnr consists of unique PDB sequences from the representative PDB chains. Each representative chain has the best structural coverage in the set of the same sequences. You could click a sequence ID to see all of PDB chains associated with the sequence ID plus sequence alignments and structural coverages.



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