|
TM0006;TM0006 |
Protein Sequence Comparative Analysis (PSCA) | |
|
TM0006 PDB Fold Similairty![]() PDB sequences with significant alignments Sequence information Score E-value JCSG39803|pdb|3DEQ_A|Muconate cycloisomerase 667 0.0 JCSG3227132|pdb|3S5S_A|Mandelate racemase/muconate lactoniz... 199 1e-51 JCSG3227176|pdb|3U9I_B|Mandelate racemase/muconate lactoniz... 192 2e-49 JCSG73909|pdb|1JPM_A|L-Ala-D/L-Glu Epimerase 191 5e-49 JCSG1663923|pdb|3IK4_B|Mandelate racemase/muconate lactoniz... 188 3e-48 JCSG360127|pdb|3JZU_A|Dipeptide Epimerase 173 1e-43 JCSG3194664|pdb|3R0U_B|Enzyme of enolase superfamily 156 2e-38 JCSG729891|pdb|3Q45_A|Mandelate racemase/muconate lactoniz... 155 4e-38 JCSG1663888|pdb|3RIT_A|Dipeptide epimerase 154 9e-38 JCSG1578867|pdb|2P88_A|Mandelate racemase/muconate lactoniz... 144 9e-35 JCSG3172743|pdb|3IJQ_A|Muconate cycloisomerase 126 2e-29 JCSG1667777|pdb|3I4K_A|Muconate lactonizing enzyme 102 3e-22 JCSG3172462|pdb|3MY9_A|Muconate cycloisomerase 97 1e-20 JCSG1559365|pdb|2QDE_A|Mandelate racemase/muconate lactoniz... 96 2e-20 JCSG220396|pdb|3MUC_A|PROTEIN (MUCONATE CYCLOISOMERASE) 95 5e-20 JCSG220100|pdb|2MUC_A|PROTEIN (MUCONATE CYCLOISOMERASE) 95 5e-20 JCSG2986285|pdb|3DG7_B|Muconate cycloisomerase 95 5e-20 JCSG217665|pdb|1MUC_A|MUCONATE LACTONIZING ENZYME 95 5e-20 JCSG2998075|pdb|3I6E_F|Muconate cycloisomerase I 95 6e-20 JCSG3240699|pdb|4DYE_A|isomerase 57 2e-08 ...morePDB sequence alignments QUERY 1 MSRIVNVKLSLKRYEYEKPFH---I-TGS-VSSESRN-VE-VEIVL-----E-SGVKGYG 47 JCSG39803 1 MSRIVNVKLSLKRYEYEKPFH---I-TGS-VSSESRN-VE-VEIVL-----E-SGVKGYG 47 JCSG3227132 21 -----------------EPFg---I-AGG-AQERAaN-Ll-VtVeL-----a-DGTlGFG 50 JCSG3227176 43 -----------------EPFg---I-ASG-AQEvARN-Ll-VaVeL-----t-DGTRGYG 72 JCSG73909 2 --KIIRIEtSriavpltKPFk---t-Alr-TvytAES-Vi-VRITy-----D-SGAvGWG 46 JCSG1663923 21 -----------------EPFa---I-ASG-AQAvAaN-Vl-VKVqL-----a-DGTlGlG 50 JCSG360127 2 --KIkQVhVraSKiKlKEtFt---I-AlG-TiESAdS-Ai-VEIet-----E-EGLvGYG 46 JCSG3194664 2 VSKIIDIKtSIiKiplKRtFi---t-Avr-sTNHidS-La-VELTL-----D-NGVKGYG 48 JCSG729891 3 ---ITQVELykSpvKlKEPFk---I-SlG-IlTHANN-Vi-VRIht-----a-SGhiGYG 46 JCSG1663888 2 --KIADIQVrtEHFpltRPYR---I-Afr-siEEidN-Li-VEIrt-----a-DGLlGlG 46 JCSG1578867 2 --KITaIhLyaiRlplRNPFv---I-SyG-sySDmpS-Ii-VKMet-----D-EGIiGYG 46 JCSG3172743 1 ------MKMTFfpYElKlrhv---F-TvA-TySRTtT-pD-VQVeI-----EyEGVtGYG 42 JCSG1667777 13 -SRILDVpLi-------RPhg---F-AtT-TSTEQHi-Ll-VSVhL-----E-NGViGYG 51 JCSG3172462 29 ---------------------------GN-VKGSvKR-Vl-LEVTs-----a-DGIvGWG 52 JCSG1559365 ------------------------------------------------------------ JCSG220396 17 -----------------RPhk---L-Amh-TmQQQtl-Vv-LRVrc-----S-DGVEGiG 46 JCSG220100 20 -----------------RPhk---L-Amh-TmQQQtl-Vv-LRVrc-----S-DGVEGiG 49 JCSG2986285 15 ---------------YtKPLR---F-ASG-evhaAEH-Vl-VRVht-----D-DGIvGvA 46 JCSG217665 20 -----------------RPhk---L-Amh-TmQQQtl-Vv-LRVrc-----S-DGVEGiG 49 JCSG2998075 28 --------------------H---g-iGr-VEGScEi-Vv-LRLVa-----E-GGAEGFG 54 JCSG3240699 23 MmKITDVdVwVvNlplvNPFt---s-SfE-TKTgEtR-Tv-VRVrt-----D-SGVEGWG 69 QUERY 48 E----A-----------S----P----SF--R---VN--G-E-RV-----E-AL-L--A- 65 JCSG39803 48 E----A-----------S----P----SF--R---VN--G-E-RV-----E-AL-L--A- 65 JCSG3227132 51 E----A-----------A----P----lp--a---fN--G-E-tq-----D-Gs-r--A- 68 JCSG3227176 73 E----A-----------A----P----fp--a---fN--G-E-tq-----D-ma-h--A- 90 JCSG73909 47 E----A-----------p----P----TL--v---IT--G-D-sM-----D-SIes--A- 65 JCSG1663923 51 E----A-----------A----P----fp--a---VS--G-E-tq-----t-Gt-s--A- 68 JCSG360127 47 E----G-----------G----P----GI--f---IT--G-E-tL-----a-Gt-L--e- 64 JCSG3194664 49 v----A-----------p----a----Tt--a---IT--G-D-tL-----Q-GMqy--i- 67 JCSG729891 47 E----C-----------S----P----fM--t---IH--G-E-sM-----D-Ta-F--i- 64 JCSG1663888 47 a----A-----------S----P----Er--H---VT--G-E-tL-----E-Acha--A- 65 JCSG1578867 47 E----G-----------v----a----Dd--H---VT--G-E-sw-----E-St-Fh-T- 65 JCSG3172743 43 E----A-----------Sm---P----pY--l-------G-E-tV-----E-SV-M---- 58 JCSG1667777 52 E----Gvvpg-------G----P----wW-------G--G-E-sV-----E-TM-k--Al 72 JCSG3172462 53 E----A-----------A----P----we--v---fT--G-t-pe-----a-AF-s--A- 70 JCSG1559365 ------------------------------------------------------------ JCSG220396 47 E----A-----------T----tvg--GL--a---yG--y-E-sp-----E-GI-k--An 67 JCSG220100 50 E----A-----------T----tig--GL--a---yG--y-E-sp-----E-GI-k--An 70 JCSG2986285 47 E----A-----------p----P----rp--f---Ty--G-E-tq-----t-GI-V--Av 65 JCSG217665 50 E----A-----------T----tig--GL--a---yG--y-E-sp-----E-GI-k--An 70 JCSG2998075 55 E----A-----------S----P----wa--v---fT--G-t-pe-----a-Sy-a--A- 72 JCSG3240699 70 E----T-----------------------------Mw--G-a-pV-----a-AI------ 80 QUERY 66 I-ENAVREMI--T----G---I------DVRN-----Y-A----RIF-E----------- 87 JCSG39803 66 I-ENAVREMI--T----G---I------DVRN-----Y-A----RIF-E----------- 87 JCSG3227132 69 a-avSLREaV--V----G---s------DARa-----W-r----aVa-R----------- 90 JCSG3227176 91 a-ilAARSLV--e----G---a------DVRE-----W-r----RIa-l----------- 112 JCSG73909 66 I-HHVLKpaL--l----G---k------SLaG-----Y-e----aILhD----------- 88 JCSG1663923 69 a-iErLQShL--l----G---a------DVRG-----W-r----KLa-a----------- 90 JCSG360127 65 t-iElfgQaI--i----G---L------NpfN-----i-e----KIh-E----------- 86 JCSG3194664 68 I-REifapVI--l----G---s------DLsD-----Y-k----QtL-E----------- 89 JCSG729891 65 V-gQyLaKgL--i----G---t------SclD-----i-V----sns-l----------- 86 JCSG1663888 66 L-DHdrlgwL--m----G---r------DIRT-----l-p----RLcrE----------- 88 JCSG1578867 66 L-KHTLtpaL--i----G---q------NpmN-----i-e----KIh-D----------- 87 JCSG3172743 59 -------NFL--k----k---V------NLEQ-----F-S----dpF-Q----------- 74 JCSG1667777 73 V-DGyLapVL--i----G---r------aVsE-----l-A----gIM-a----------- 94 JCSG3172462 71 L-DiyLRpLI--l----G---a------pIKR-----v-r----ELM-a----------- 92 JCSG1559365 ------------------------------------------------------------ JCSG220396 68 I-DahLapaL--i----G---L------aAdN-----i-n----aaM-l----------- 89 JCSG220100 71 I-DahLapaL--i----G---L------aAdN-----i-n----aaM-l----------- 92 JCSG2986285 66 I-EQyfapaL--i----G---L------tLtE-----r-e----vah-t----------- 87 JCSG217665 71 I-DahLapaL--i----G---L------aAdN-----i-n----aaM-l----------- 92 JCSG2998075 73 L-DRyLRpLV--i----G---r------rVgD-----r-V----aIM-D----------- 94 JCSG3240699 81 V-RRmApDLIgtS----p---F------aLEa-----F-h----Rkq-H----------- 104 QUERY 88 -I-T--------D--R----L--------F------G------------F------P--- 96 JCSG39803 88 -I-T--------D--R----L--------F------G------------F------P--- 96 JCSG3227132 91 -a-l--------r--E----a--------s------Ggg----------a------g--- 101 JCSG3227176 113 -a-l--------p--a----L--------p------G------------M------tg-- 122 JCSG73909 89 -I-q--------h--l----L--------t------G------------n------m--- 97 JCSG1663923 91 -M-l--------D--H----ae-------h------e------------a------a--- 100 JCSG360127 87 -V-m--------D--K----I--------s------A------------Fa-----P--- 96 JCSG3194664 90 -L-A--------f--K----k--------v------m------------F------n--- 98 JCSG729891 87 -L-m--------D--a----Ii-------Y------G------------n------s--- 96 JCSG1663888 89 -L-A--------E--R----L--------p------A------------a------P--- 97 JCSG1578867 88 -M-m--------D--Nt---I--------Y------G------------v------P--- 97 JCSG3172743 75 -L-e--------D--i----L--------s------y------------v------d--- 83 JCSG1667777 95 -d-l--------E--R----V--------v------A------------r------a--- 103 JCSG3172462 93 -r-m--------D--Km---L--------v------G------------h------g--- 102 JCSG1559365 ------------------------------------------------------------ JCSG220396 90 -k-l--------D--K----L--------ak-----G------------n------t--- 99 JCSG220100 93 -k-l--------D--K----L--------ak-----G------------n------t--- 102 JCSG2986285 88 -r-m--------a--R----t--------v------G------------n------P--- 96 JCSG217665 93 -k-l--------D--K----L--------ak-----G------------n------t--- 102 JCSG2998075 95 -e-A--------a--R----a--------v------A------------hc-----t--- 104 JCSG3240699 105 -M-V--------p--f----F--------Y------G------------Y------l--- 113 QUERY 97 S----------L-------K------------A--A---V------Q-FATLDALSQE-- 113 JCSG39803 97 S----------L-------K------------A--A---V------Q-FATLDALSQE-- 113 JCSG3227132 102 A----------a-------R------------C--A---I------E-tAiLDALTKR-- 118 JCSG3227176 123 S----------a-------R------------C--A---I------E-tAiLDALTRR-- 139 JCSG73909 98 S----------a-------K------------A--A---V------E-MAlyDGwAQm-- 114 JCSG1663923 101 A----------a-------R------------C--G---L------E-MAmLDALTRH-- 117 JCSG360127 97 A----------a-------K------------A--A---I------D-IAcyDlMGQK-- 113 JCSG3194664 99 S----------aa------K------------m--A---I------D-LAyhDlLAKE-- 116 JCSG729891 97 c----------I-------K------------S--A---f------N-IAlyDlaAQH-- 113 JCSG1663888 98 A----------a-------R------------A--A---L------D-MAlhDlVAQc-- 114 JCSG1578867 98 T----------a-------K------------A--A---I------D-IAcFDiMGKK-- 114 JCSG3172743 84 S----------LspkdtaaK------------A--A---V------D-IAlhDlVGKl-- 107 JCSG1667777 104 r----------ya------K------------A--A---V------D-vAmhDAwARS-- 121 JCSG3172462 103 E----------a-------K------------A--A---V------E-MAlLDiLGKa-- 119 JCSG1559365 104 -------------------K------------A--T---V------D-FAlhDlVGKR-- 118 JCSG220396 100 f----------a-------K------------S--G---I------E-sAlLDAqGKR-- 116 JCSG220100 103 f----------a-------K------------S--G---I------E-sAlLDAqGKR-- 119 JCSG2986285 97 T----------a-------K------------A--A---I------D-MAmwDALGQS-- 113 JCSG217665 103 f----------a-------K------------S--G---I------E-sAlLDAqGKR-- 119 JCSG2998075 105 E----------a-------K------------A--A---L------D-sAlLDlaGRi-- 121 JCSG3240699 114 G----------y-------a------------AiaA---V------D-vAcwDAMGKa-- 132 QUERY 114 -------------L--------GTQVC-YLLGG------------K---R----D-E--- 128 JCSG39803 114 -------------L--------GTQVC-YLLGG------------K---R----D-E--- 128 JCSG3227132 119 -------------a--------GmpLw-aFFGG------------S---g----t-a--- 133 JCSG3227176 140 -------------a--------rlpLw-aFFGG------------a---a----t-S--- 154 JCSG73909 115 -------------c--------GlpLy-qMLGG------------y---R----D-t--- 129 JCSG1663923 118 -------------y--------hmpLh-vFFGG------------v---s----k-Q--- 132 JCSG360127 114 -------------a--------qlpLy-qLLGG------------y---d----N-Q--- 128 JCSG3194664 117 -------------q--------diSVA-kLLGA------------K---a----N-S--- 131 JCSG729891 114 -------------a--------GlpLy-aFLGG------------K---K----D-K--- 128 JCSG1663888 115 -------------L--------GlpLv-eILGr------------a---H----D-S--- 129 JCSG1578867 115 -------------L--------NqpVy-qLIGG------------Ry--H----E-E--- 130 JCSG3172743 108 -------------L--------GApwy-kIwGl------------N---K----E-K--- 122 JCSG1667777 122 -------------L--------NVpVr-dLLGG------------tv--R----D-K--- 137 JCSG3172462 120 -------------t--------GlSVA-dLLGG------------Rv--R----D-R--- 135 JCSG1559365 119 -------------F--------GVpVy-qLLGG------------K---t----i-Er-- 134 JCSG220396 117 -------------L--------GlpVs-eLLGG------------Rv--R----D-S--- 132 JCSG220100 120 -------------L--------GlpVs-eLLGG------------Rv--R----D-S--- 135 JCSG2986285 114 -------------L--------rlSVs-eMLGG------------y---t----D-R--- 128 JCSG217665 120 -------------L--------GlpVs-eLLGG------------Rv--R----D-S--- 135 JCSG2998075 122 -------------s--------NlpVw-aLLGG------------Kc--R----D-t--- 137 JCSG3240699 133 -------------t--------GqSVt-dLLGG------------av--R----D-E--- 148 QUERY 129 I----------------E-----T----------D-K---T-V--------G------I- 137 JCSG39803 129 I----------------E-----T----------D-K---T-V--------G------I- 137 JCSG3227132 134 L----------------t-----T----------D-i---T-I--------t------t- 142 JCSG3227176 155 L----------------E-----T----------D-v---T-I--------t------t- 163 JCSG73909 130 L----------------E-----T----------D-y---T-V--------S------V- 138 JCSG1663923 133 L----------------E-----T----------D-m---T-I--------t------a- 141 JCSG360127 129 V----------------i-----T----------D-i---T-L--------G------I- 137 JCSG3194664 132 I----------------v-----T----------D-v---S-I--------S------c- 140 JCSG729891 129 Ii---------------Q-----T----------D-y---T-V--------S------I- 138 JCSG1663888 130 L----------------p-----T----------S-v---T-I--------G------I- 138 JCSG1578867 131 F----------------p-----V----------t-h---V-L--------S------I- 139 JCSG3172743 123 tp---------------S-----T----------t-f---T-I--------G------I- 132 JCSG1667777 138 V----------------D-----V----------t-w---A-L--------G------V- 146 JCSG3172462 136 I----------------p-----l----------S-f---S-I--------A------d- 144 JCSG1559365 135 I----------------p-----l----------g-l---V-L--------G------a- 143 JCSG220396 133 L----------------E-----V----------a-w---T-L--------A------s- 141 JCSG220100 136 L----------------E-----V----------a-w---T-L--------A------s- 144 JCSG2986285 129 M----------------R-----V----------S-h---m-L--------G------F- 137 JCSG217665 136 L----------------E-----V----------a-w---T-L--------A------s- 144 JCSG2998075 138 I----------------p-----l----------S-c---S-I--------A------n- 146 JCSG3240699 149 Vpitalitra-------D-----A----------p-g---A-T--------p------a- 166 QUERY 138 -----D--T---V--------------EN-RVK-E-AKKIF-E-E----G-FRVIKI--- 160 JCSG39803 138 -----D--T---V--------------EN-RVK-E-AKKIF-E-E----G-FRVIKI--- 160 JCSG3227132 143 -----g--S---p--------------ER-aeE-a-ARRaa-a-m----G-FRALKV--- 165 JCSG3227176 164 -----g--S---V--------------ta-aAR-a-AQaIv-a-R----G-vtTIKI--- 186 JCSG73909 139 -----N--S---p--------------EE-mAa-D-AENyL-K-Q----G-FQTLKI--- 161 JCSG1663923 142 -----g--d---e--------------vH-aAa-S-AKaIL-a-R----G-IKsIKV--- 164 JCSG360127 138 -----D--e---p--------------Nv-mAQ-K-AvEkv-K-l----G-FdTLKI--- 160 JCSG3194664 141 -----g--N---V--------------aE-tIQ-N-iQNgv-E-a----N-FtAIKV--- 163 JCSG729891 139 -----D--e---p--------------HK-mAa-D-AvQIk-K-N----G-FEIIKV--- 161 JCSG1663888 139 -----k--p---V--------------EE-tLa-E-AREhL-a-l----G-FRVLKV--- 161 JCSG1578867 140 -----a--d---p--------------EN-mAE-E-AaSMI-Q-K----G-YQsFKM--- 162 JCSG3172743 133 -----D--TpdvV--------------Ra-KTK-E-CagLF-N----------ILKV--- 154 JCSG1667777 147 -----l--p---L--------------Dv-aVa-E-iEErI-E-Ef---G-nRsFKL--- 170 JCSG3172462 145 -----p--d---f--------------Da-dLE-R-mRaMv-p-a----G-htVFKM--- 167 JCSG1559365 144 -----g--e---p--------------Ea-vAE-E-AlaVL-R-E----G-FHfVKL--- 166 JCSG220396 142 -----g--d---T--------------aR-dIa-E-ARhML-EiR----r-hRVFKL--- 165 JCSG220100 145 -----g--d---T--------------aR-dIa-E-ARhML-EiR----r-hRVFKL--- 168 JCSG2986285 138 -----D--d---p--------------vK-mVa-E-AERIr-E-ty---G-INTFKV--- 161 JCSG217665 145 -----g--d---T--------------aR-dIa-E-ARhML-EiR----r-hRVFKL--- 168 JCSG2998075 147 -----p--d---f--------------Da-dIa-l-mERLr-a-D----G-vgLIKL--- 169 JCSG3240699 167 -----D--l---p--------------Ka-mAE-H-AvRVv-E-E----GgFdAVKL--- 190 QUERY 161 --K----V-------------------G--------------------------E----- 164 JCSG39803 161 --K----V-------------------G--------------------------E----- 164 JCSG3227132 166 --K----V-------------------G--------------------------g----- 169 JCSG3227176 187 --K----I-------------------Gagdpdatti-----------------R----- 199 JCSG73909 162 --K----V-------------------Gk-------------------------D----- 166 JCSG1663923 165 --K----Ta------------------G--------------------------v----- 169 JCSG360127 161 --K----V-------------------G--------------------------t----- 164 JCSG3194664 164 --K----T-------------------G--------------------------a----- 167 JCSG729891 162 --K----V-------------------G--------------------------g----- 165 JCSG1663888 162 --K----L-------------------c--------------------------g----- 165 JCSG1578867 163 --K----V-------------------G--------------------------t----- 166 JCSG3172743 155 --K----L-------------------G--------------------------R----- 158 JCSG1667777 171 --K----M-------------------G--------------------------ag---- 175 JCSG3172462 168 --K----T-------------------G--------------------------v----- 171 JCSG1559365 167 --K----A-------------------G--------------------------g----- 170 JCSG220396 166 --K----I-------------------G--------------------------a----- 169 JCSG220100 169 --K----I-------------------G--------------------------a----- 172 JCSG2986285 162 --K----V-------------------G--------------------------R----- 165 JCSG217665 169 --K----I-------------------G--------------------------a----- 172 JCSG2998075 170 --K----T-------------------Gf-------------------------R----- 174 JCSG3240699 191 --K----g-------------------t--------------------------t----- 194 QUERY 165 ---------N-L------K--------------E-DIEA----V----EEI--A-K-V-T 180 JCSG39803 165 ---------N-L------K--------------E-DIEA----V----EEI--A-K-V-T 180 JCSG3227132 170 ---------R-L------aa-------------S-Dpar----I----EaI--h-a-A-A 186 JCSG3227176 200 ---------T-M------E--------------H-DLar----I----vaI--r-d-V-A 215 JCSG73909 167 ---------D-I------a--------------t-DIar----I----QEI--r-KrV-g 183 JCSG1663923 170 ---------D-V------a--------------y-DLar----L----RaI--h-Q-A-A 185 JCSG360127 165 ---------G-I------E--------------a-DIar----V----KaI--r-EaV-g 181 JCSG3194664 168 ---------D-F------N--------------R-DIQl----L----KaL--dnE-f-S 184 JCSG729891 166 ---------S-k------E--------------l-DVEr----I----RmI--r-E-A-A 181 JCSG1663888 166 ---------D-e------E--------------Q-DFEr----L----RRL--h-E-T-l 181 JCSG1578867 167 ---------N-V------K--------------E-DVKr----I----EaV--reR-V-g 183 JCSG3172743 159 ---------D-----------------------N-DkEm----I----EtI--r-S-V-T 172 JCSG1667777 176 ---------D-p------a--------------E-DtRr----V----aEL--A-ReV-g 192 JCSG3172462 172 ---------K-p------h--------------a-Eelr----I----lEt--m-R-g-e 187 JCSG1559365 171 ---------p-L------K--------------a-DIam----V----aEV--r-RaV-g 187 JCSG220396 170 ---------NpV------E--------------Q-DLKh----V----vtI--k-ReL-g 187 JCSG220100 173 ---------NpV------E--------------Q-DLKh----V----vtI--k-ReL-g 190 JCSG2986285 166 ---------R-p------v--------------Q-ldtA----V----vRa--l-R-e-r 181 JCSG217665 173 ---------NpV------E--------------Q-DLKh----V----vtI--k-ReL-g 190 JCSG2998075 175 ---------D-h------a--------------f-DImr----L----ElI--A-R-d-f 190 JCSG3240699 195 ---------D-c------a--------------g-DVai----L----RaV--r-E-A-l 210 QUERY 181 R-----G--A-----K-----Y-------------------------------------- 185 JCSG39803 181 R-----G--A-----K-----Y-------------------------------------- 185 JCSG3227132 187 p-----G--A-----S-----l-------------------------------------- 191 JCSG3227176 216 p-----t--A-----R-----l-------------------------------------- 220 JCSG73909 184 s-----A--V-----K-----l-------------------------------------- 188 JCSG1663923 186 p-----t--A-----p-----l-------------------------------------- 190 JCSG360127 182 f-----d--i-----K-----l-------------------------------------- 186 JCSG3194664 185 K-----N--i-----K-----F-------------------------------------- 189 JCSG729891 182 g-----d--S-----i-----t-------------------------------------- 186 JCSG1663888 182 a-----G--r-----a-----v-------------------------------------- 186 JCSG1578867 184 N-----d--i-----a-----i-------------------------------------- 188 JCSG3172743 173 ------d--l-----p-----i-------------------------------------- 176 JCSG1667777 193 d-----r--V-----S-----l-------------------------------------- 197 JCSG3172462 188 f-----G--e-----R-----i-------------------------------------- 192 JCSG1559365 188 d-----d--V-----d-----l-------------------------------------- 192 JCSG220396 188 d-----S--A-----S-----v-------------------------------------- 192 JCSG220100 191 d-----S--A-----S-----v-------------------------------------- 195 JCSG2986285 182 f-----Gdai-----E-----l-------------------------------------- 188 JCSG217665 191 d-----S--A-----S-----v-------------------------------------- 195 JCSG2998075 191 p-----e--f-----R-----v-------------------------------------- 195 JCSG3240699 211 p-----G--V-----N-----l-------------------------------------- 215 QUERY 186 -I-------V--DA-NMG-----YTQ-KE-A----VEFARAVYQ----------K----- 208 JCSG39803 186 -I-------V--DA-NMG-----YTQ-KE-A----VEFARAVYQ----------K----- 208 JCSG3227132 192 -I-------L--DG-NgG-----lTa-gE-A----LaLVahArR----------l----- 214 JCSG3227176 221 -I-------L--DG-NcG-----YTa-pD-A----LRLldmLgv----------h----- 243 JCSG73909 189 -r-------L--DA-NQG-----Wrp-KE-A----VtaiRkMeD----------a----- 211 JCSG1663923 191 -I-------V--DG-NcG-----Ydv-ER-A----LaFCaAcka----------E----- 213 JCSG360127 187 -r-------L--DA-NQA-----WTp-KD-A----VKaiQALaD----------y----- 209 JCSG3194664 190 -r-------f--DA-NQG-----WNl-aQ-T----kQFiEeInK----------y----- 212 JCSG729891 187 -Lr------I--DA-NQG-----WSv-Et-A----IEtltlL------------E----- 208 JCSG1663888 187 -Vr------V--Dp-NQS-----YdR-dg-l----LRLdRlVqE----------l----- 210 JCSG1578867 189 -r-------V--DV-NQG-----W---KN-S----ANtltALrS----------l----- 209 JCSG3172743 177 -a-------V--DA-NQG-----WkD-RQyA----LDMiHwLkE----------K----- 200 JCSG1667777 198 -r-------I--Di-Nar-----WdR-Rt-A----LHYlpiLaE----------a----- 220 JCSG3172462 193 -d-------LrlDf-NQA-----lTp-fg-A----MKIlRdV------------d----- 215 JCSG1559365 193 -F-------I--Di-NgA-----WTy-dQ-A----LttiRALeK---------------- 214 JCSG220396 193 -r-------V--DV-NQy-----WdE-SQ-A----IRaCQVLgD----------N----- 215 JCSG220100 196 -r-------V--DV-NQy-----WdE-SQ-A----IRaCQVLgD----------N----- 218 JCSG2986285 189 -y-------V--DG-NrG-----WSa-aE-S----LRamReM------------a----- 209 JCSG217665 196 -r-------V--DV-NQy-----WdE-SQ-A----IRaCQVLgD----------N----- 218 JCSG2998075 196 -r-------V--Dy-NQG-----lei-dE-A----VprVldVaQ----------f----- 218 JCSG3240699 216 -r-------V--Dp-NaA-----WSv-pD-S----VRaGiALeE---------------- 237 QUERY 209 ----G-I----------------------------------------DIA---V--Y--- 215 JCSG39803 209 ----G-I----------------------------------------DIA---V--Y--- 215 JCSG3227132 215 ----G-a----------------------------------------DVA---L--l--- 221 JCSG3227176 244 ----G-I----------------------------------------vpA---L--F--- 250 JCSG73909 212 ----G-L----------------------------------------gIe---L--v--- 218 JCSG1663923 214 ----S-I----------------------------------------pMV---L--F--- 220 JCSG360127 210 ----q-I----------------------------------------ELV---------- 214 JCSG3194664 213 ----S-L----------------------------------------NVe---I--i--- 219 JCSG729891 209 ----p-y----------------------------------------NIq---h--c--- 215 JCSG1663888 211 ----G-I----------------------------------------EF-------i--- 215 JCSG1578867 210 ----GhL----------------------------------------NId---w--i--- 217 JCSG3172743 201 ----G-I------------------------------------------V---M--i--- 205 JCSG1667777 221 ----G-V----------------------------------------EL-------F--- 225 JCSG3172462 216 ----A-F----------------------------------------rpT---f--i--- 222 JCSG1559365 215 ------y----------------------------------------NLS---k--i--- 220 JCSG220396 216 ----G-I----------------------------------------DLi---------- 220 JCSG220100 219 ----G-I----------------------------------------DLi---------- 223 JCSG2986285 210 ----d-L----------------------------------------DLl---f--a--- 216 JCSG217665 219 ----G-I----------------------------------------DLi---------- 223 JCSG2998075 219 ----q-p----------------------------------------DFi---------- 223 JCSG3240699 238 ------L----------------------------------------DLe---y--l--- 243 QUERY 216 --EQPVR--R-EDIEGLKFVRFH-SPF-PVAADESARTK-FDVMRLVKE-EAV-DYV-NI 264 JCSG39803 216 --EQPVR--R-EDIEGLKFVRFH-SPF-PVAADESARTK-FDVMRLVKE-EAV-DYV-NI 264 JCSG3227132 222 --EQPVp--R-DDwDGMKeVtrR-Agv-dVAADESAaSa-eDVLRVAaE-RAA-tvV-NI 270 JCSG3227176 251 --EQPVa--K-DDeEGLRrLtat-rrv-PVAADESVaSa-tDAaRLARN-aAV-DvL-NI 299 JCSG73909 219 --EQPVH--K-DDLaGLKkVtda-Tdt-PImADESVfTp-rQAFEVLQt-RSA-DlI-NI 267 JCSG1663923 221 --EQPLp--R-EDwaGMaqVtaQ-SgF-aVAADESARSa-hDVLRIARE-gTA-SvI-NI 269 JCSG360127 215 --EQPVK--R-RDLEGLKYVtsQ-vnt-tImADESCfda-qDALELVKK-gTV-DvI-NI 263 JCSG3194664 220 --EQPVK--y-yDIKAMaeItkf-SnI-PVVADESVfda-kDAeRVIdE-QAc-NmI-NI 268 JCSG729891 216 --EEPVs--R-NlytALpkIRqa-crI-PImADESCcNS-FDAeRLIQi-QAc-Dsf-NL 264 JCSG1663888 216 --EQPfp--a-grtDwLRaLpka-irr-rIAADESllgp-aDAFaLAap-pAAcgif-NI 265 JCSG1578867 218 --EQPVi--a-DDIDAMahIRsk-TdL-PLmiDEGlKSS-rEMrQIIKl-EAA-DkV-NI 266 JCSG3172743 206 --EQPMp--K-EQLDdIaWVtqQ-SPL-PVfADESlQrl-gDVaaL--K-gAf-tgI-NI 252 JCSG1667777 226 --EQPTp--a-DDLEtLReItrR-Tnv-sVmADESVwTp-aEALaVVKa-QAA-DvI-aL 274 JCSG3172462 223 --EQPVp--R-RhLDAMagfaaa-ldt-PIlADESCfda-vDLMEVVRR-QAA-DaI-SV 271 JCSG1559365 221 --EQPLp--a-wDLDGMarLRgk-vat-PIyADESAQel-hDLLaIINK-gAA-DgL-mI 269 JCSG220396 221 --EQPIs--R-iNrgGqvrLNqR-TPa-PImADESiESv-eDAFsLAaD-gAA-Sif-aL 269 JCSG220100 224 --EQPIs--R-iNrgGqvrLNqR-TPa-PImADESiESv-eDAFsLAaD-gAA-Sif-aL 272 JCSG2986285 217 --EElcp--a-DDVlSrRrLvgQ-ldM-PfiADESVpTp-aDVtReVlg-gSA-taI-SI 265 JCSG217665 224 --EQPIs--R-iNrgGqvrLNqR-TPa-PImADESiESv-eDAFsLAaD-gAA-Sif-aL 272 JCSG2998075 224 --EQPVR--a-HhFElMarLRgl-Tdv-PLlADESVygp-eDMVRaAhE-gic-DgV-SI 272 JCSG3240699 244 --EDPc-----vgIEGMaqVKak-vrI-PLCTNmcVvrf-eDfapaMRl-NAV-DvI-Hg 290 QUERY 265 -K-L-M-K-S-G-ISDA-LAIVEIA---ESSGL-KLMIGC---MG-E-SS---LG---IN 301 JCSG39803 265 -K-L-M-K-S-G-ISDA-LAIVEIA---ESSGL-KLMIGC---MG-E-SS---LG---IN 301 JCSG3227132 271 -K-L-M-K-G-G-IAEA-LdIAaVA---RAAGL-gLMIGg---Mv-E-Sv---LA---MT 307 JCSG3227176 300 -K-L-M-K-c-G-IvEA-LdIAaIA---RTAGL-hLMIGg---Mv-E-Sl---LA---MT 336 JCSG73909 268 -K-L-M-K-AgG-ISgA-ekInaMA---EAcGV-EcMVGs---Mi-E-TK---LG---IT 305 JCSG1663923 270 -K-L-M-K-A-G-VAEG-LkMIaIA---QAAGL-gLMIGg---Mv-E-Si---LA---MS 306 JCSG360127 264 -K-L-M-KcG-G-IhEA-LkInQIC---ETAGI-EcMIGC---MAeE-TT---IG---IT 302 JCSG3194664 269 -K-L-a-K-TgG-IlEA-qkIkKLA---DSAGI-ScMVGC---Mm-E-Sp---aG---Il 306 JCSG729891 265 -K-L-s-K-SaG-ITNA-LnIIRLA---EQAhM-pVQVGg---Fl-E-Sr---LG---FT 302 JCSG1663888 266 -K-L-M-KcG-G-LApA-rrIAtIA---ETAGI-dLMwGC---Md-E-Sr---IS---Ia 303 JCSG1578867 267 -K-L-M-KcG-G-IypA-VkLAHqA---EmAGI-EcQVGs---Mv-E-SS---VA---sS 304 JCSG3172743 253 -K-L-M-KcT-G-MrEA-wkMVtLA---HAlGM-RVMVGC---Mt-E-TS---cA---IS 290 JCSG1667777 275 -K-t-t-KhG-G-LlES-kkIAaIA---EAGGL-achgAt---sl-E-Gp---IG---ta 312 JCSG3172462 272 -K-I-M-KcG-G-LmkA-qSLMaIA---DTAGL-pgygGt---Lw-E-GG---IA---La 309 JCSG1559365 270 -K-t-Q-K-AgG-LlkA-qrwLtLA---RlANL-pVIcGC---Mv-g-SG---Le---aS 307 JCSG220396 270 -K-I-a-K-N-G-gprAvLrtAQIA---EAAGI-gLygGt---Ml-E-GS---IG---tl 307 JCSG220100 273 -K-I-a-K-N-G-gprAvLrtAQIA---EAAGI-gLygGt---Ml-E-GS---IG---tl 310 JCSG2986285 266 -K-t-a-R-T-G-FTgS-trVhHLA---EGlGL-dMVMGn---Qi-D-GQ---IG---ta 302 JCSG217665 273 -K-I-a-K-N-G-gprAvLrtAQIA---EAAGI-gLygGt---Ml-E-GS---IG---tl 310 JCSG2998075 273 -K-I-M-K-SgG-LTrA-qTVARIA---aAhGL-maygGd---Mf-E-AG---LA---hl 310 JCSG3240699 291 -d-V-y-KwG-G-IAaT-kALAahC---ETfGL-gMnLhs---gG-E------LG---Ia 326 QUERY 302 Q---SV---HFAL-----------GT---G-----AF----EF-H------D-LDSHLML 324 JCSG39803 302 Q---SV---HFAL-----------GT---G-----AF----EF-H------D-LDSHLML 324 JCSG3227132 308 a---SA---cFAa-----------Gl---G-----GF----SF-v------D-LDTpLFL 330 JCSG3227176 337 v---SA---cFAa-----------Gq---G-----GF----RF-v------D-LDTpLFL 359 JCSG73909 306 a---AA---HFAa-----------Sk---r-----nI----tr-f------D-FDApLML 328 JCSG1663923 307 f---SA---NLAa-----------GN---G-----GF----DF-i------D-LDTpLFI 329 JCSG360127 303 a---AA---HLAa-----------Aq---k-----nI----tr-a------D-LDA---- 321 JCSG3194664 307 a---TA---sFAL-----------Ae---d------I----tv-a------D-LDpldwV 328 JCSG729891 303 a---AA---HvAL-----------vS---k-----TI----cY-Y------D-FDTpLMF 325 JCSG1663888 304 a---AL---HaAL-----------Ac---p-----At----RY-l------D-LDGsFdL 326 JCSG1578867 305 a---Gf---HvAF-----------Sk---k-----iI----ts-v------E-LtGpLkF 327 JCSG3172743 291 a---As---QF--------------S---p-----Av----DF-a------D-LDGNLLI 310 JCSG1667777 313 a---SL---QFAa-----------ST---k-----AI----SY----------------- 326 JCSG3172462 310 a---GT---QLia-----------AT---p-----GIslgcEF-Y---------mpHhVL 334 JCSG1559365 308 p---AA---HLlaandwiaqfpqeNA---G-----pL----HI-HdclnsrD-IDNdIaL 347 JCSG220396 308 a---SA---HafL-----------tl---r-----qL----tWgt------E-LfGpLLL 331 JCSG220100 311 a---SA---HafL-----------tl---r-----qL----tWgt------E-LiGpLLL 334 JCSG2986285 303 c---TV---sF-------------GT---------AF----E------------------ 312 JCSG217665 311 a---SA---HafL-----------tl---r-----qL----tWgt------E-LfGpLLL 334 JCSG2998075 311 a---GT---HMia-----------AT---p-----eItlgcEF-Y---------QAsyFL 335 JCSG3240699 327 t---AA---HLAV----------------------------------------------- 333 QUERY 325 KEEVFRGKFI--QDGPRMRVKDQ 345 JCSG39803 325 KEEVFRGKFI--QDGPRMRVKDQ 345 JCSG3227132 331 aENpFdGgFV--QrGPaLsLE-- 349 JCSG3227176 360 aENpFdGgMt--yhG-------- 372 JCSG73909 329 KtDVFNGgIt--ySG-------- 341 JCSG1663923 330 aEHpFiGgFa--QtGgtLQLaD- 349 JCSG360127 320 ----------------------- 321 JCSG3194664 329 aKDLYsdyIt--fNePNIiLKD- 348 JCSG729891 326 EaDpvRGgIV------------- 335 JCSG1663888 327 aRDVaEGgFI--lEdgRLRVtER 347 JCSG1578867 328 tKDI--GNLh--yDvPfIRLNEK 346 JCSG3172743 311 SNDrFKGveV--vNG-------- 323 JCSG1667777 325 ----------------------- 326 JCSG3172462 335 tEDVLEeRIa--NSAgHViVpD- 354 JCSG1559365 348 NvprFEGgYLypNDGPgLgIE-- 368 JCSG220396 332 tEEI------------------- 335 JCSG220100 335 tEEI------------------- 338 JCSG2986285 311 ----------------------- 312 JCSG217665 335 tEEI------------------- 338 JCSG2998075 336 NEDILEtpFr--vEAgQViVpD- 355 JCSG3240699 332 ----------------------- 333 Note Homologous search is done using BLAST from NCBI BLAST against database pdbnr with expect (E-value cut-off) at 0.001. The structure of a PDB sequence may be fully or partly solved. The non-redundant database pdbnr consists of unique PDB sequences from the representative PDB chains. Each representative chain has the best structural coverage in the set of the same sequences. You could click a sequence ID to see all of PDB chains associated with the sequence ID plus sequence alignments and structural coverages. |
